501紅與黑的碰撞 嫌疑
502紅與黑的碰撞 潔白
503紅與黑的碰撞 決死
504紅與黑的碰撞 殉職
推薦指數：5
說明：柯南與FBI合作對抗組織，比以前的主線劇情更加激動人心，而且還埋下了壹些伏筆。
507卡拉Ok包房的死角（前篇）
508卡拉Ok包房的死角（後篇）
推薦指數：3
說明：本集本堂瑛佑出現並且告別，柯南泄露身份，至於原因，樓主自己看吧，很有愛！
509紅白黃色與偵探團
推薦指數：4
說明：自稱研究生的沖矢昴登場，他的真實身份涉及主線喲！
515怪盜基德的瞬間移動魔術
推薦指數：3
說明：看名字就知道是和基德的對決，因為本人不算基德迷，所以分稍微低了點。
522新壹的真實身份與小蘭的眼淚
523真正想問的事
推薦指數：5
說明：柯南因為意外變回新壹！新蘭有愛的對話，新壹平次默契破案，很值得壹看！
524憎恨的藍色火花（前篇）
525憎恨的藍色火花（後篇）
推薦指數：3
說明：本集暴露了小哀壹個小秘密，結尾有意料之外的人出現哦
530都市傳說的真相（前篇）
推薦指數：4
說明：高木和佐藤的感情戲哦
538怪盜基德vs最強金庫（後篇）
推薦指數:4
說明：以抓基德為畢生目標的鈴木次郎吉大叔居然找基德幫忙？
542魚兒消失的壹角巖（前篇）
543魚兒消失的壹角巖（後篇）
推薦指數：4
說明：沖矢昴登場，展現出敏捷身手，小哀再度感到組織氣息，他是誰？
557與危險的二人同行
558死亡之館 赤壁（三顧之禮）
559死亡之館 赤壁（掌中之物）
561死亡之館 赤壁（空城之計）
推薦指數：3
說明：與大和敢助青梅竹馬的警官出現！精彩對手戲！
563偵探團vs強盜團（騷亂）
564偵探團vs強盜團（沈默）
推薦指數：5
說明：朱蒂與赤井的過去回憶，臉上帶傷的赤井與朱蒂相遇！
578召喚危機的紅色前兆
580逼近的黑色時刻
581紅色的搖擺目標
推薦指數：5
說明：黑衣組織發現傷疤赤井，朱蒂與卡邁爾先後看見傷疤赤井的身影……沖矢昴暗中行動，與朱蒂相遇……
586黑暗中消失的麒麟之角
587基德vs四神偵探團
推薦指數：4
說明：基德與偵探團的對決，結局如何呢？
621福爾摩斯的默示錄（0 is start）
推薦指數：5
說明：新壹對蘭大本鐘下的告白（本系列都很精彩，建議樓主完整地看，最後壹集新壹父母出現）
623緊急事態252（後篇）
推薦指數：4
說明：偵探團陷入困境，危急關頭，解救他們的竟然是……
精彩集數還有：
656柯南vs平次 東西偵探推理對決
679偵探們的夜想曲（事件）
680偵探們的夜想曲（綁架）
681偵探們的夜想曲（推理）
682偵探們的夜想曲（波本）
684壹丁點都不原諒（前篇）
695泡泡，熱氣和煙（前篇）
696泡泡，熱氣和煙（後篇）
701工藤優作的未解決案件（前篇）
702工藤優作的未解決案件（後篇）
711迫近灰原秘密的身影（後篇）
712漆黑的特快列車（發車）
713漆黑的特快列車（隧道）
714漆黑的特快列車（交叉）
715漆黑的特快列車（終點）
716密室裏的柯南
717解開謎題的波本
733又甜又冰的送貨車（前篇）
734又甜又冰的送貨車（後篇）
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736怪盜基德與赤面人魚（後篇）
738裝滿果實的寶箱（前篇）
739裝滿果實的寶箱（後篇）
745茱蒂的追憶與賞花陷阱
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756嫌疑犯是京極真（後篇）
757怪盜基德vs京極真（前篇）
758怪盜基德vs京極真（後篇）
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766紅色女人的慘劇（惡靈）
767紅色女人的慘劇（復仇）
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777堤無津河風箏事件（前篇）
778堤無津河風箏事件（後篇）