閩南理工學院學費各專業不同，最低23000元/年；個別專業最高24000元/年，詳見如下：
專業名稱批次學費經濟學本科23000元/年金融工程本科24000元/年國際經濟與貿易本科23000元/年藝術教育本科24000元/年學前教育本科24000元/年小學教育本科24000元/年阿拉伯語本科23000元/年
翻譯本科、商務英語本科、信息與計算科學本科、機械設計制造及其自動化本科、機械電子工程本科、電氣工程及其自動化本科、電子信息工程本科、通信工程本科、光電信息科學與工程本科、機器人工程本科、物聯網工程本科、數字媒體技術本科、數據科學與大數據技術本科24000元/年
土木工程本科24000元/年、給排水科學與工程本科23000元/年、建築電氣與智能化本科23000元/年、智能建造本科23000元/年、信息管理與信息系統本科23000元/年、工程管理本科23000元/年、工程造價本科24000元/年、財務管理本科24000元/年、人力資源管理本科23000元/年、審計學本科24000元/年
資產評估本科23000元/年、物流管理本科23000元/年、電子商務本科23000元/年、服裝設計與工程本科23000元/年、經濟學本科23000元/年、金融工程本科24000元/年、國際經濟與貿易本科23000元/年