員工繳納個人所得稅是根據員工當月收入計算的，和是否繳納五險壹金沒有直接關系。但是再有繳納五險壹金的情況下應該扣除繳納部分再進行計算。所以就算單位沒有為員工繳納五險壹金，只要員工當月收入達到繳納個人所得稅的標準，依然是需要繳稅的。
依據《個人所得稅法》
第四條 下列各項個人所得，免納個人所得稅：
壹、省級人民政府、國務院部委和中國人民解放軍軍以上單位，以及外國組織、國際組織頒發的科學、教育、技術、文化、衛生、體育、環境保護等方面的獎金；
二、國債和國家發行的金融債券利息；
三、按照國家統壹規定發給的補貼、津貼；
四、福利費、撫恤金、救濟金；
五、保險賠款；
六、軍人的轉業費、復員費；
七、按照國家統壹規定發給幹部、職工的安家費、退職費、退休工資、離休工資、離休生活補助費；
八、依照我國有關法律規定應予免稅的各國駐華使館、領事館的外交代表、領事官員和其他人員的所得；
九、中國政府參加的國際公約、簽訂的協議中規定免稅的所得；
十、經國務院財政部門批準免稅的所得。
第六條 應納稅所得額的計算：
壹、工資、薪金所得，以每月收入額減除費用三千五百元後的余額，為應納稅所得額。
二、個體工商戶的生產、經營所得，以每壹納稅年度的收入總額減除成本、費用以及損失後的余額，為應納稅所得額。
三、對企事業單位的承包經營、承租經營所得，以每壹納稅年度的收入總額，減除必要費用後的余額，為應納稅所得額。
四、勞務報酬所得、稿酬所得、特許權使用費所得、財產租賃所得，每次收入不超過四千元的，減除費用八百元；四千元以上的，減除百分之二十的費用，其余額為應納稅所得額。
五、財產轉讓所得，以轉讓財產的收入額減除財產原值和合理費用後的余額，為應納稅所得額。
六、利息、股息、紅利所得，偶然所得和其他所得，以每次收入額為應納稅所得額。
個人將其所得對教育事業和其他公益事業捐贈的部分，按照國務院有關規定從應納稅所得中扣除。
對在中國境內無住所而在中國境內取得工資、薪金所得的納稅義務人和在中國境內有住所而在中國境外取得工資、薪金所得的納稅義務人，可以根據其平均收入水平、生活水平以及匯率變化情況確定附加減除費用，附加減除費用適用的範圍和標準由國務院規定。
擴展資料：
2018年工資交稅計算
工資個稅的計算公式為:
應納稅額=(工資薪金所得 -“五險壹金”-扣除數)×適用稅率-速算扣除數
個稅起征點是5000，使用超額累進稅率的計算方法如下：
繳稅=全月應納稅所得額*稅率-速算扣除數
實發工資=應發工資-四金-繳稅
全月應納稅所得額=(應發工資-四金)-5000
扣除標準：個稅按5000元/月的起征標準算
如果某人的工資收入為7000元，他應納個人所得稅為：(7000—5000)×3%—0=60(元)。
工資扣稅標準
應納個人所得稅稅額=應納稅所得額×適用稅率-速算扣除數
應納稅所得額=扣除三險壹金後月收入-扣除標準
參考資料：