賬務處理是KIS迷妳版的核心模塊，主要包括憑證處理、賬簿、期末處理等。
憑證處理將幫助企業完成日常業務的核算工作，可直接處理各類本外幣業務、數量金額核算業務，同時具有自動生成收付轉通知單，引出標準格式憑證，多核算項目核算，自動校驗各種平衡關系，處理表外科目憑證等功能。
賬簿處理提供了快而準的多種查詢篩選功能。總賬可按科目級別、幣別、科目範圍等查詢；明細賬可按期間範圍、幣別、科目範圍查詢；還提供了多欄賬、數量金額明細賬、核算項目分類總賬等，並且輸出格式優化美觀，將幫助企業及時掌握企業經營狀況。
期末處理提供了在期末進行制造費用、產成品成本的結轉、期末調匯及損益結轉等功能，幫助企業完成期末的這些核算處理工作。 金蝶KIS提供標準格式憑證、報表、摘要、工資核算方法、憑證等的引入引出，簡化用戶的數據處理。並且可實現與金蝶K/3系統的集成應用，例如上級集團使用金蝶K/3系統，則可以利用集團應用功能，向上級集團上報報表或憑證等賬務數據，供集團編制合並報表或進行賬務數據查詢，滿足集團應用的需要。