防城港有著獨特的地理位置和地理條件。港口水深，避風，航道短，不淤積，城市和陸地面積廣闊，可用海岸線長。港口位於中國西南和東南亞的中心，背靠中國西南的經濟腹地；越南西鄰廣東、海南、澳大利亞，是西南走向東南亞、走向世界最便捷的海上通道。1983年，防城港被國務院列為對外開放口岸，港口建設步伐不斷加快。自1987以來，港口吞吐量逐年增加。1998，吞吐量突破700萬噸。目前，防城港擁有泊位28個，其中萬噸級以上深水泊位14個；集裝箱專用泊位年吞吐量25萬標箱，港口實際年吞吐量超過2500萬噸。是中國沿海20個主要樞紐港之壹，承擔著中國西南和中南地區進出貨物的主要轉運任務。
自對外開放以來，防城港與80個國家和地區的230個港口有貿易往來，開通了至韓國、馬來西亞、泰國、新加坡和香港的集裝箱航線，還開通了至海南的客貨滾裝航線。目前已建成糧食、化肥、水泥、礦石、煤炭、化工等中轉基地。
2004年，全市貨物吞吐量近2000萬噸，其中防城港完成16萬噸以上。隨著防城港20萬噸級碼頭的投入使用，以及13-17號萬噸級泊位的加快建設，未來5年港口年綜合吞吐量有望達到6000萬噸，港口核心競爭力將進壹步提升。