總局
協助中心領導完成年度主要工作的規劃制定，參與政務、管理事務和保障服務，承擔日常政務及相關事務的聯絡工作；負責處理公文、收發、機要、保密、打印和檔案管理，使用和管理印章和介紹信；負責計劃、總結、報告、制度等各類文稿的起草和審核，負責宣傳報道、信息綜合和調研；負責辦理NPC代表和CPPCC委員的建議和提案；負責各類會議；負責車輛調度，設施設備的管理和維護，以及財務和工資工作；負責並指導健康、安全和安保事務；完成領導交辦的其他任務。
商務辦公室
負責行政審批(包括行政許可、非許可審批和行政服務等)的管理。);負責對納入中心的管理部門的業務工作進行指導，參與辦理申報事項的相關手續；負責部門之間的業務銜接和聯絡事宜的組織協調，組織聯合審計會議，聯合竣工驗收並起草聯合審計會議紀要，參與中心例會的會務工作；收集整理各類業務報表，做好統計、歸檔和分析工作；負責中心的依法行政和政務公開工作；參與服務內容、程序和操作系統的修訂、完善和解釋，並負責咨詢和服務；負責中介服務等前置審批環節的指導；檢查指導全市便民服務網絡建設，負責市、縣(市、區)政務中心與市政務中心分中心之間的業務協調；完成領導交辦的其他任務。
信息辦公室
負責中心的信息規劃和年度工作計劃並組織實施；負責中心機房、信息控制室和網絡系統的建設、維護和管理，確保網絡安全、穩定、高效運行；負責中心終端設備的綜合信息發布和日常檢查，確保正常運行；負責行政審批管理系統和門戶網站的管理和維護，與電子政務內網、電子政務外網、專網(包括縣、區級中心和市政務中心分中心的網絡系統)的連接和協調，根據業務需要及時做好系統優化完善、網絡互通和資源共享工作；完成領導交辦的其他任務。