二院二部主要從事整體武器系統，206等廠是分廠。理論上是平級的，但實際上每個廠的設備都要交給二部。新時期十年，二院形成了以導彈武器系統總體技術、系統研究、系統集成技術為主導的技術體系，走出了壹條適應現代戰爭系統化、多樣化需求的成功之路。
中國航天科工集團第二研究院第二總體設計部是我國最早成立的地空導彈總體設計部。經過幾代航天人的不懈努力，已發展成為二院導彈武器系統技術總師單位，從事關系國家安全的戰略產業，肩負著富國強軍的歷史使命，為構築國家安全基石做出了巨大貢獻。
目前已與多所高校建立了聯合實驗室，與相關單位建立了戰略合作夥伴關系，形成了產學研用相結合的創新格局。擁有“控制科學與工程”和“航天科學與技術”兩個博士後科研工作站，兩個博士/碩士學位授予點。建部以來，* * *獲得國家級科技進步獎22項(含特等獎3項)，部級科技進步獎366項。