1975-76賽季，ABA與NBA合並，而聖路易斯精神隊是僅有的幾支沒有加入NBA的ABA球隊。在當年8月5日舉行的ABA球員解散選秀大會上，馬龍被波特蘭開拓者隊在首輪第5順位挑中。21歲的馬龍並沒有為開拓者出戰，1976-77賽季開始前，開拓者把他送到了布法羅勇士隊，換來了1978年的首輪選秀權。即便如此，這還不算完，在只代表勇士隊打了2場比賽之後，他又被球隊送到了休斯頓火箭隊，勇士隊得到的是兩個未來選秀權。
在休斯頓，馬龍找到了歸宿。火箭隊的教練湯姆·尼薩爾克，正是他在ABA猶他明星隊時的教練。在火箭陣中馬龍很快找到了自己的位置，並顯示出了聯盟數壹數二的籃板能力，尤其是在前場籃板方面。當季，他***出戰82場比賽，場均13.2分13.1籃板。他的場均籃板統計僅排在比爾·沃頓和賈巴爾之後，列聯盟第三。同時他的前場籃板紀錄還打破了聯盟單賽季紀錄，***搶得437個前場籃板球，之前的紀錄是由保羅·西拉斯的365個保持著（兩年後馬龍又打破了自己在這壹年創下的這個紀錄）。馬龍場均2.21個蓋帽排名聯盟第7。馬龍的優秀表現幫助球隊壹路過關斬將，打進了東部決賽。不過在那裏他們輸給了更為老道的76人隊。馬龍***參加了12場季後賽的比賽，場均18.8分16.9籃板。東部半決賽對陣華盛頓子彈隊第2場比賽，球隊加時取勝，馬龍單場15個前場籃板創下了季後賽紀錄。
1977-78賽季，馬龍的第二個NBA賽季由於右腳應力性骨折提前結束，因此他錯過了火箭最後的23場比賽。不過，他仍然是聯盟的前場籃板王（380個），場均15個籃板仍然是聯盟第2，排在萊納德-羅賓遜之後（15.7）。1978年，馬龍參加了全明星賽。
1978-79賽季，馬龍進入職業籃球的第五個賽季，是他在火箭隊的第三個賽季，也是他職業生涯最好的賽季之壹。馬龍場均可以得到24.8分和17.6個籃板，他在23歲的年紀便奪得常規賽最有價值球員榮譽。由於在休賽期增重15磅，馬龍的體重達到了235磅，這也讓他得以在禁區如魚得水。該賽季，馬龍單賽季搶下587個前場籃板，創下聯盟球員單賽季所搶進攻籃板數之最。個人得分榜上，馬龍位居第五，他的投籃命中率為54%，創生涯新高。他入選了聯盟年度最佳陣容第壹隊和年度最佳防守陣容第二隊，他還是1979年全明星賽上東部的首發中鋒。在1979年2月9日對陣新奧爾良爵士隊（現猶他爵士隊）的比賽中他單場抓下37個籃板，創下個人單場籃板紀錄。不過，火箭隊在季後賽中首輪就0-2被老鷹隊淘汰，馬龍在這兩場比賽中總***拿下49分和41個籃板。
1979-80賽季，馬龍場均拿下25.8分和14.5個籃板，個人得分榜上排名第五，籃板榜上位居斯文-納特（場均15個籃板）之後。此外，馬龍連續第三年入選全明星賽，這也是他連續第二年作為首發出現在全明星賽的舞臺。賽季末，馬龍入選了年度最佳陣容第二隊。馬龍用出色的表現幫助火箭隊在首輪2-1擊敗聖安東尼奧馬刺隊，在決定命運的第三戰中，馬龍全場得到37分和20個籃板。不過在東部半決賽中，火箭隊遭到了凱爾特人隊的橫掃。
1980-81賽季，馬龍重新在籃板方面統治聯盟，而且在接下來的四個賽季中，馬龍成功守住籃板王寶座。該賽季馬龍打了80場比賽，場均可以搶下14.8個籃板，並且入選年度最佳陣容第二隊，連續第四次入選全明星陣容。該賽季，馬龍場均拿下27.8分，僅次於阿德裏·丹特利（30.7分）。1981年3月11日，馬龍在和金州勇士隊的比賽中單場砍下51分，全場他28投20中，其中罰球12罰11中。單場51分也是火箭當時隊史上球員單場所得到的第三高分，排在他前面的是卡爾文·墨菲的57分和埃爾文·海耶斯的54分。中部賽區，火箭隊以40勝42負的戰績和堪薩斯城國王隊並列第二。季後賽中，馬龍場均可以得到26.8分和14.5個籃板，他率隊壹路殺至總決賽，但是六場比賽下來他們輸給了凱爾特人，當時的凱爾特人隊由二年級生拉裏·伯德帶領。
1981-82賽季，馬龍場均拿下31.1分和14.7個籃板，並且在三年內第二次獲得年度最有價值球員獎項。該賽季的得分王是喬治-格文，他場均可以得到32.3分。在賽季總出場時間和場均出場時間方面，馬龍均是聯盟第壹，他該賽季壹***出戰3398分鐘，場均出戰42分鐘。此外，馬龍還搶下558個進攻籃板，為聯盟單賽季最高。賽季末，馬龍入選年度最佳陣容第壹隊。1982年2月2日對陣聖叠戈快船隊的比賽中，馬龍單場拿下53分，而在同年2月11日和西雅圖超音速隊的比賽中，馬龍單場搶下21個進攻籃板，打破了之前自己創下的個人單場進攻籃板紀錄。馬龍在火箭隊的最後壹個賽季，火箭隊殺入了季後賽，但是在首輪被超音速2-1淘汰出局。馬龍在系列賽中場均得到24分和17個籃板。 火箭隊進入重建階段，摩西·馬龍在1982年夏天成為自由球員，他試水自由球員市場。1982年9月2日，費城76人隊簽下馬龍，火箭隊匹配76人為馬龍開出的合同，為此他們得到了卡德維爾·瓊斯和76人隊1983年的壹個首輪選秀簽。當時的76人隊已經擁有朱利葉斯·歐文、安德魯·托尼、莫裏斯·奇克斯和鮑比·瓊斯，馬龍的加入讓球隊的實力更上壹層樓，尤其是馬龍能為球隊禁區提供強大的戰鬥力。
1982-83賽季，馬龍獲得常規賽最有價值球員（MVP）榮譽，他也成為聯盟歷史上第壹位連續兩個賽季奪得常規賽MVP、且這兩個常規賽MVP是在兩支球隊所獲的球員。在北美四大體育運動項目裏，馬龍的這項紀錄直到1993年才有巴裏·邦德斯（美國職棒大聯盟球員）打破。馬龍場均可以搶下15.3個籃板，位居聯盟榜首，這也是馬龍連續第三年在籃板榜上排名第壹。此外，歐文本賽季場均也可以得到21.4分，而托尼場均也有19.7分進賬。馬龍的場均得分雖然滑落到24.5分，但依然排在聯盟個人得分榜上第五位。1983年馬龍連續第六次入選全明星賽，賽季末他入選聯盟年度最佳陣容第壹隊和聯盟年度最佳防守陣容第壹隊。在爭奪總冠軍的路途中，76人隊只輸了壹場比賽，總決賽上他們4-0橫掃洛杉磯湖人隊。整個季後賽13場比賽，馬龍場均可以拿下26分和15.8個籃板，他當選總決賽MVP。在季後賽開始前，馬龍的“fo，fo，fo”（季後賽橫掃對手奪冠）口號就已震驚聯盟，雖然季後賽的最終結果是“fo，fi，fo”（4-0，4-1，4-0），但76人隊在場上統治力的強大就可見壹斑。最終，76人以12勝1負的戰績奪冠，這在奪冠路途上僅次於湖人隊在2001年的15勝1負。 1983-84賽季，馬龍連續第四年獲得聯盟籃板王榮譽，這也是他職業生涯第五次獲此殊榮，他該賽季場均可以搶下13.4個籃板。不過，馬龍該賽季因傷只參加了71場比賽，這也是他自1977-78賽季以來單賽季出場次數最少的壹個賽季。即便如此，馬龍該賽季場均依然可以交出22.7分的成績單，賽季末入選聯盟年度最佳陣容第壹隊。1984年馬龍連續第七個賽季入選全明星賽，但是他因傷缺席了本屆全明星賽。季後賽中，馬龍五場比賽場均可以得到21.4分和13.8個籃板，76人隊在首輪即遭新澤西籃網隊淘汰。
1984-85賽季，馬龍場均可以抓下13.1個籃板，他連續第五個賽季當選籃板王，這也是聯盟歷史上第壹位連續五個賽季獲得籃板王的球員。20世紀60年代，張伯倫曾有兩次連續四個賽季當選籃板王的經歷。1985年馬龍連續第八個賽季被選入全明星陣容，該賽季他場均可以得到24.6分（聯盟第九位）。賽季末，馬龍入選年度最佳陣容第壹隊，這也是他職業生涯第四次獲此殊榮。常規賽最有價值球員評選方面，馬龍位列第三，該賽季的常規賽MVP被凱爾特人隊的拉裏·伯德奪得。1984年11月28日，馬龍職業生涯總得分達到15000分；1985年3月29日，馬龍抓下個人生涯第10000個籃板。而在11月14日和底特律活塞隊的比賽中，馬龍單場砍下51分。1985年76人殺入東部決賽，但是五場比賽之後被凱爾特人隊淘汰出局。季後賽中，馬龍場均得到20.2分和10.6個籃板。
1985-86賽季，職業生涯第10個賽季，也是馬龍在費城的最後壹個賽季。1986年3月28日和密爾沃基雄鹿隊的壹場比賽中，馬龍右眼受傷，他因此缺席了球隊該賽季的最後八場比賽和整個季後賽。沒有了馬龍，76人在東部半決賽中苦戰七場不敵雄鹿隊。在1985-86賽季為76人隊效力的74場比賽中，馬龍場均有23.8分和11.8個籃板進賬，得分榜上排名第七，籃板榜上第四。該賽季的籃板王是活塞隊的比爾·蘭比爾（場均13.1個籃板），這也是籃板王殊榮六個賽季內首次旁落。1986年，馬龍連續第九次入選全明星賽，但是賽季末的年度最佳陣容裏沒有他的名字，這也是馬龍自1978年以來首次無緣年度最佳陣容榜單。 暫居華盛頓
1985-86賽季結束後不久，摩西·馬龍被交易到華盛頓子彈隊，和馬龍壹起被交易的還有特裏·卡特萊奇以及兩個首輪選秀權，子彈隊送出的則是傑夫·羅蘭德和克裏夫·羅賓遜。
1986-87賽季，馬龍因傷狀態下滑，場均依然可以得到24.1分和11.3個籃板，並且賽季末入選聯盟年度最佳陣容第二隊。此外，馬龍該賽季連續第10個賽季入選全明星賽。1987年4月12日，馬龍在和活塞隊的比賽中拿下個人職業生涯的第20000分，4月8日在和籃網的比賽中他單場得到50分，成為子彈隊史上單場至少拿下50分的第三人，其余兩人為厄爾·門羅（56分）和菲爾·切尼爾（52分）。子彈隊殺入季後賽，但是首輪即被活塞隊淘汰。三場比賽中，馬龍場均有20.7分和12.7個籃板進賬。
1987-88賽季，在子彈隊的第二個賽季，馬龍場均可以拿下20.3分和11.2個籃板，個人得分榜和籃板榜上他分別位列第19和第4位。馬龍連續第11個賽季入選全明星賽，他也是該賽季四名在得分榜進入前20、籃板榜進入前10的球員之壹。馬龍在出場的79場比賽中有76場比賽得分上雙，其中55次砍下兩雙。1988年子彈隊再次殺入季後賽，不過首輪再壹次被活塞隊淘汰。系列賽五戰，馬龍場均拿下18.6分和11.2個籃板。
老鷹歲月
1988-89賽季，老鷹隊簽下自由球員馬龍，而馬龍該賽季依然打出了全明星級別的水準。馬龍和多米尼克·威爾金斯組成老鷹隊的前場，他場均可以得到20.2分和11.8個籃板，連續第12個賽季入選全明星陣容。該賽季，馬龍在參加的81場比賽中有75場比賽得分上雙，其中55次得到兩雙。1989年2月4日和太陽隊的比賽中，馬龍砍下賽季最高的37分。季後賽老鷹隊則未能突破首輪，他們被雄鹿隊淘汰，而馬龍在首輪五場比賽中場均可以得到21分和12個籃板。
1989-90賽季，在老鷹隊的第二個賽季，馬龍的場均數據終於跌破20+10，該賽季他場均拿下18.9分和10個籃板，未能連續第11個賽季至少拿下20+10的數據。不過，馬龍依然在本賽季有20次為隊內得分王，41次成為隊內籃板王。邁克·弗拉特羅執教老鷹隊的最後壹個賽季，他們只取得了41勝41負的戰績，這也是球隊五年來首次無緣季後賽。
1990-91賽季，馬龍在中鋒位置上首發了前15場比賽，當老鷹隊更換主教練後，新帥鮑比·維斯將馬龍放入替補席，壓縮他的出場時間。該賽季盡管馬龍82場全勤，但他整個賽季出場時間只有1912分鐘，這也是他15年來首次賽季總出場時間不足2000分鐘。馬龍場均只有10.6分和8.1個籃板進賬，而他的場均出場時間則為23.3分鐘，這三項數據均為其生涯新低。1990年11月3日和步行者隊的比賽中，馬龍命中個人職業生涯第7695個罰球，由此超越奧斯卡·羅伯特森成為聯盟歷史上命中罰球數最多的球員。而在11月21日與雄鹿隊的比賽中，馬龍拿下個人生涯第25000分；1991年3月15日和小牛隊的比賽中，馬龍抓下個人生涯第15000個籃板。1991年老鷹隊殺入季後賽，但是首輪即遭活塞隊淘汰，而馬龍在季後賽中場均也只有4.2分和6.2個籃板進賬。
征戰密爾沃基
1990-91賽季結束後，馬龍成為自由球員，密爾沃基雄鹿隊將其簽下。
1991-92賽季，雄鹿隊將馬龍放到了首發陣容，最終他在82場常規賽中場均交出15.6分和9.1個籃板的成績單。馬龍該賽的場均得分位列隊內第二，場均籃板隊內第壹，單賽季82場常規賽馬龍有54場是隊內籃板王。該賽季，馬龍有2次單場拿下30分，1992年3月27日雄鹿和超音速的比賽中，馬龍單場更是抓下19個籃板。處於重建期的雄鹿取得31勝51負的戰績，和夏洛特黃蜂隊並列位居中部賽區倒數第壹。
1992-93賽季，馬龍因為背傷缺席了大部分比賽。直到1993年3月27日他才迎來新賽季的首場比賽，最終馬龍該賽季只打了11場比賽，場均得到4.5分和4.4個籃板。4月12日與熱火隊的比賽中，馬龍打出個人賽季最好的壹場比賽，這場比賽他打了18分鐘，拿下12分和9個籃板。盡管球隊擁有不少天賦實力不錯的球員，但是這個賽季雄鹿隊依然在泥潭中掙紮，他們取得28勝54負的戰績，在中部賽區墊底。
重回76人
1993年的八月份76人隊簽下馬龍，讓他負責帶壹下新秀肖恩·布拉德利。
1993-94賽季是馬龍在NBA的第18個賽季，也是他進入職業籃球的第20個賽季。該賽季馬龍也是當時聯盟唯壹的壹位仍在NBA效力的前ABA球員。這個賽季，馬龍代表76人隊打了55場比賽，以替補身份出戰的他場均可以得到5.3分和4.1個籃板。賽季末，馬龍的職業生涯總得分達到了27360分，當時位居聯盟歷史個人總得分榜的第三位。而在總出場次數方面則以1312場位列第三，總籃板（16166）位居第五，其中進攻籃板（6711）位居聯盟第壹位，罰球命中數（8509）同樣位居聯盟歷史第壹，制造罰球總數（11058）則位居聯盟第二。
生涯最後壹季
1994年，馬龍以自由球員身份和馬刺隊簽約，這也是他職業生涯的最後壹個賽季。1994-95賽季，馬龍擔任大衛·羅賓遜的替補。該賽季和夏洛特黃蜂隊的壹場比賽中，馬龍命中壓哨三分，這也是他職業生涯命中的第八個三分球。馬龍為馬刺隊打了17場比賽，這17場比賽都是在1994年的11月份和12月份。馬龍便因右小腿跟腱撕裂，被放入了傷病名單。1月15日， 馬龍接受了手術。
1996年，馬龍當之無愧當選了NBA50大巨星，2001年入選了籃球名人堂。
摩西·馬龍在21年的職業籃球生涯中***出征1455場，其中NBA1329場，排在羅伯特·帕裏什和賈巴爾之後。在NBA19個賽季中***得到27409分，位列第七。他以8531個罰球命中個數排名NBA第壹，11090次的罰球出手數也僅次於威爾特·張伯倫。籃板球總數為16212個，排名第五。其中他搶的前場籃板球（進攻籃板球）有6731個，比排名第二的選手整整高出2000多個，這是NBA各項技術指標中第1名和第2名之間差距第二大的壹個（差距第壹大的是助攻，第壹名斯托克頓高出第二名基德4000多個）。此外他還保持著另外2項NBA搶進攻籃板球的紀錄：壹個賽季587個前場籃板球和壹場比賽21個前場籃板球。其同時，他還是史上出戰第三多者（1329場），出戰時間第六多者（45071分鐘）和總出手次數的第十把交椅（19225次）。1973-74賽季起，聯盟開始將進攻籃板和防守籃板分開計算，馬龍不但以驚人的6731個進攻籃板問鼎史上桂冠，而其9481個防守籃板的數字也僅次於超級長命的“酋長”羅伯特·帕裏什。
摩西·馬龍在21年的籃球生涯中，他得分達到29580分，列賈巴爾，卡爾·馬龍，邁克爾·喬丹，科比，威爾特·張伯倫和朱利葉斯·歐文之後，居史上第七。攬下17834個籃板，僅次於威爾特·張伯倫，比爾·拉塞爾，居史上第三。此外，他的罰球命中數（9018）和罰球出手數（11864）都是史上最二，僅次於卡爾·馬龍，出戰場次（1455場）居史上第五，出戰時間（49444分鐘）居史上第三，總命中數（10277）和總出手數（20750）則居第九。馬龍職業生涯中有11個賽季場均得分超過20。馬龍另保持著壹項令人瞠目的紀錄：他連續1207場比賽沒有被罰下，這個數字無人可及。他還是聯盟單季進攻籃板，單場進攻籃板紀錄（21個）的保持者——後壹項紀錄的締造時間是1977年2月2日，對手西雅圖超音速隊。