法律分析
如果協議有明確條款說明蓋章後生效，但只有法人代表簽字，沒蓋公章，協議還不能生效。沒有這個蓋章後生效的條款，雙方有法人代表簽字，沒蓋公章，協議就已經生效。合同的生效是指已經成立的合同在當事人之間產生了壹定的法律拘束力，也就是通常所說的法律效力。合同的成立與生效常常是緊密聯系在壹起的。當事人訂立合同的目的，就是要使合同產生拘束力，從而實現合同所規定的權利和利益，如果合同不能生效，則合同等於壹紙空文，當事人也就失去了訂約目的。壹般認為應具備以下條件：1、訂約主體應為雙方或多方當事人；2、具備法律規定的要約與承諾這兩個階段或過程；3、對主要條款達成壹致的意思表示(有些情形還需要某種形式作為載體來進行表現)。此外，對於實踐性合同來說還應把實際交付物作為成立要件。如果具備以上條件，合同就能成立。至於成立的合同是否有效，還得看其是否“依法”成立。只要是依法成立的合同，都應有效。
法律依據
《中華人民***和國民法典》 第四百九十條 當事人采用合同書形式訂立合同的，自當事人均簽名、蓋章或者按指印時合同成立。在簽名、蓋章或者按指印之前，當事人壹方已經履行主要義務，對方接受時，該合同成立。法律、行政法規規定或者當事人約定合同應當采用書面形式訂立，當事人未采用書面形式但是壹方已經履行主要義務，對方接受時，該合同成立。