1.違反股權轉讓合同的訴訟主要是轉讓方和受讓方就股權轉讓合同約定義務的履行和權利的實現發生的糾紛；
(二)假冒公司股東簽名非法轉讓公司股份引起的訴訟主要是指公司股東簽名被他人冒用，導致其股份被轉讓，喪失股東資格的訴訟。
(3)公司增資擴股引起的訴訟主要包括公司股東或公司經理為引進外部資金，控制公司股東或公司經理以公司名義與部分股東或股東以外的第三方簽訂投資或投資協議，從而改變公司股權結構的行為。從表面上看，這種行為雖然沒有直接導致股權轉讓，但增資擴股往往會導致公司其他股東權益的稀釋和公司控制權的轉移，在很多地方相當於公司股東權益的轉移。因此，我們在此將其列為公司股權轉讓糾紛的特殊表現形式。
(4)因工商行政管理部門的行為引起的訴訟，如公司股權錯誤登記、因需要辦理工商變更登記而拒絕登記、擅自辦理公司股東股權變更登記等。
二、如何處理股權轉讓協議糾紛
(壹)無效股權轉讓合同的處理辦法
壹般來說，有效的股權轉讓合同應符合以下條件:股權轉讓合同的主體符合法律法規；股權轉讓合同約定的股份或者股權必須依法可以轉讓；股權轉讓方式符合法律規定；當事人意思表示真實，不存在欺詐、脅迫簽訂合同的情形；不存在惡意串通或損害國家集體或第三人利益的行為。股權轉讓合同不符合上述情形之壹的，壹般應當認定股權轉讓合同無效。
(2)處理股權轉讓糾紛應註意的事項。
這些情況也是目前公司股權轉讓實踐中比較突出且爭議較大的問題。其他情形，如因涉及國有資產、外商投資管理、證券市場監管等而受到法律法規特別限制的情形，在認定股權轉讓合同效力時必須予以重視和考慮，但這些情形更多的是行政性和政策性。所以以上情況要多加考慮。
首先，了解股權轉讓協議糾紛的類型對我們來說非常重要。只有了解這個問題，針對不同類型的股權轉讓協議糾紛，才能正確處理股權轉讓協議糾紛。由於股權轉讓是壹個相對復雜的問題，它將面臨越來越多的困難，這需要我們謹慎。