協議簽名後修改的內容合法嗎？有效嗎？

協議有效。這對妳很不利。現實中，解決合同條款約定不明確問題的方法和途徑，既不能依賴於合同壹方，也不能依賴於政府主管部門，更不能依賴於法院，主要還得依靠法律中介組織提供的法律幫助。該情況應該存在協議簽訂的程序是否合法有效問題，但要具體問題具體分析。您在協議書上已經簽名，漏洞在於您同意交給對方復印，協議書是先復印兩份，再往上面簽字的，簽字時需有能夠提供證明的第三方在場。