喀什光照充足,無霜期220d左右,年有效積溫可達4200℃·d,晝夜溫差大,適於糧、棉、瓜、果和其它經濟作物生長;可分為5個氣候區:① 喀什平原氣候區。包括喀什北部、中部廣大沖積平原地區,年平均氣溫在11.4℃～11.7℃。② 沙漠荒漠氣候區。包括巴楚南部、麥蓋提東部和葉城東北部,屬塔克拉瑪幹沙漠荒漠區。大陸性氣候極顯著,年平均氣溫在11℃以上,年降水量在40mm以下。③ 山地丘陵氣候區。包括葉城中部,巴楚和伽師北部,疏附、英吉沙和莎車西部海拔1500～3000m的山區丘陵地帶。年平均氣溫在11℃以下,年降水量在70mm以上。④ 帕米爾高原氣候區。主要是塔什庫爾幹塔吉克自治縣。年平均氣溫在5℃以下。⑤ 昆侖山氣候區。主要包括塔什庫爾幹塔吉克自治縣南部和葉城縣南部。年平均氣溫在5℃以下,山峰終年積雪,氣候嚴寒,全年可分為冷暖兩季。