1、定義不同
科員：新錄用公務員試用期滿合格後，大學專科、大學本科、獲得雙學士學位的大學本科畢業生（含學制為六年以上的大學本科畢業生）、研究生班畢業和未獲得碩士學位的研究生按科員職務。
辦事員：辦事員是機關工作人員的壹種職別。
2、級別不同
辦事員是機關工作人員的壹種職別，在科員之下，升任科員需要3年以上時間。辦事員需要負責打印以分會名義發出的重要文件、工作匯報、會長講話以及其他重要文字材料。
3、任職條件不同
科員：大學專科畢業生、大學本科畢業生、獲得雙學士學位的大學本科畢業生（含學制為六年以上的大學本科畢業生）、研究生班畢業和未獲得碩士學位的研究生。
辦事員：直接從各類學校畢業生中錄用的、沒有工作經歷的公務員：高中和中專畢業生。
4、待遇不同
按照級別大小，科員的待遇肯定是要比辦事員好的。
參考資料：
參考資料：