1996年6月經陜西省人民政府批準，將縣轄的9區、10鎮、58鄉撤銷，建立19鎮、19鄉。
2001年11月經陜西省政府批準，合並部分鄉鎮，全縣轄18鎮、12鄉。鄉鎮以下行政村501個，村以下村民組3805個。
2002年4月，成立社區居民委員會14個。2002年12月，漢中市民政局根據市委、市政府《關於印發〈理順漢中經濟開發區管理體制實施方案〉的通知》，將南鄭縣大河坎鎮所屬的丁舒營村、董家營村、康家營村、蘇家山村、回龍寺村、張家村等6個村民委員會劃出，設立漢中經濟開發區南區辦事處，劃歸漢中經濟開發區管轄。鄉鎮以下行政村495個，居委會13個；村以下村民組3770個。
2011年6月24日，根據漢中市民政局《關於鄉鎮機構改革中撤鄉並鎮行政區劃調整方案的批復》，全縣由原來的30個鄉鎮撤並為22個鎮，由原495個行政村3762個村民組撤並到393個行政村3054個村民組。至此，全縣有22個建制鎮，393個行政村，14個社區居委會，3054個村民組。 南鄭縣屬北亞熱帶濕潤氣候區。由於地理因素、季風環流等影響，氣候具有以下特征：
①地處海陸氣候分界處，包括兩個氣候帶：北亞熱帶和暖溫帶，尤以北亞熱帶氣候特征最為明顯。
②具有顯著的季風氣候特征。冬季受蒙古高壓控制，經常有幹冷氣流進入，天氣多陰沈，幹旱少雨，東北風較多，但風力較弱；時有寒潮侵襲，但氣溫又不至過低。春季是北方幹冷氣流與南方濕熱氣流交替的時令，乍寒乍暖，天氣多變，有時“清明時節雨紛紛”，有時則吹黃沙風。夏季東南季風活動頻繁，濕熱氣流進入，雨熱同季，多雷雨，伴有狂風；時有幹旱發生。秋季北方冷氣團與南方暖氣團相遇，境內往往陰雨連綿，有時整月地皮不幹；但有時也出現幹旱（俗稱“秋老虎”）天氣。這壹特征，是導致秋季日照時數偏少的因素之壹。
③受地形影響，氣溫、降水垂直差異顯著：米倉山北坡氣溫由北向南遞減；降水則由北向南遞增。
④災害性天氣如暴雨、低溫、連陰雨、幹旱等頻繁。