2002年01月，任中***雲南省委副秘書長、省委政策研究室主任，
2003年03月，任中***雲南省玉溪市委書記。
2006年09月，當選玉溪市委書記。在2006年9月9日召開的中國***產黨玉溪市第三屆委員會第壹次全體會議上，孔祥庚同誌當選為中***玉溪市委書記。
2011年9月21日，中國***產黨玉溪市第四屆委員會第壹次全體會議選舉孔祥庚為市委書記。
2012年12月14日上午，市委召開全市領導幹部大會，省委常委、省委組織部部長劉維佳宣布省委關於玉溪市委主要領導同誌職務調整的決定：張祖林任中***玉溪市委委員、常委、書記；孔祥庚免去中***玉溪市委書記、常委、委員職務，另有任用。
2013年省人大民族委主任委員、省委第六督導組組長