1、地理環境復雜：宜萬鐵路沿線地理環境復雜，包括崇山峻嶺、峽谷河流等，施工條件差，隧道和橋梁工程較多，對工程質量和施工水平要求極高。
2、交通不便：鐵路經過地區經濟條件落後，交通不便，給施工帶來壹定困難，同時也增加了建設成本。