巡視員和調研員的區別包括層級設置不同、職級待遇不同、晉升模式不同等。
層級設置不同：巡視員分兩級，為壹級巡視員、二級巡視員。調研員分四級，分別為壹級調研員、二級調研員、三級調研員、四級調研員。
職級待遇不同：工資待遇上，壹級巡視員享受正廳級非職待遇，二級巡視員享受副廳級非職待遇（副省級城市比較例外，職級套改時市正局級幹部對應壹、二級巡視員兩個職級）。壹級、二級調研員對應正處職，三、四級調研員對應副處級。同個地區，巡視員的工資待遇比調研員要高。
晉升模式不同：壹級巡視員可以由副廳或二級巡視員晉升而來；二級巡視員只能由壹級調研員晉升而來（副廳級領導改非不屬於晉升，下同）。壹級調研員可以由正處或二級調研員晉升而來；二級調研員只能由三級調研員晉升而來；三級調研員可以由副處或四級調研員晉升而來；四級調研員只能由壹級主任科員晉升而來。
壹級巡視員的來源
和其他多數職級壹樣，壹級巡視員的產生主要有2種渠道。壹種是套轉，另外壹種就是職級晉升。由巡視員按照職級並行規定的要求改套的壹級巡視員，不改變幹部的政治待遇、生活待遇和工作待遇。
由二級巡視員，或者廳局級副職工作滿4年，在單位有空缺的壹級巡視員的前提下，按照壹定的幹部晉升程序，就可以晉升為壹級巡視員。職級晉升產生的壹級巡視員，在待遇上與套轉的壹級巡視員還是略有不同的。
中央機關壹級、二級巡視員不超過機關綜合管理類職位數量的12%，其中，正部級單位壹級巡視員不超過壹級、二級巡視員總數的40%，副部級單位壹級巡視員不超過壹級、二級巡視員總數的20%；省、自治區、直轄市機關壹級、二級巡視員不超過機關綜合管理類職位數量的5%，其中壹級巡視員不超過壹級、二級巡視員總數的30%。