1、確定了“三個代表”重要思想是我們黨必須長期堅持的指導思想，並把它作為靈魂貫穿整個報告的始終。
2、明確了“三個代表”重要思想在執政、興國兩個方面的指導意義，是加強和改進黨的建設、推進我國社會主義自我完善和發展的強大理論武器。也就是說，“三個代表”重要思想對鄧小平理論的繼承和發展，不是局部的，而是全方位的。
3、在去年“七壹”講話對“三個代表”重要思想科學內涵作了全面論述的基礎上，又深刻闡述了“三個代表”重要思想的關鍵、核心和本質，系統論述了全面貫徹“三個代表”重要思想的四項基本要求。
4、系統總結了十三屆四中全會以來十三年的十條基本經驗，極大地充實和豐富了“三個代表”重要思想的科學內涵。
十六大報告內容：
（1）過去五年的工作和十三年的基本經驗；
（2）全面貫徹“三個代表”重要思想；
（3）全面建設小康社會的奮鬥目標；
（4）經濟建設和經濟體制改革；
（5）政治建設和政治體制改革；
（6）文化建設和文化體制改革；
（7）國防和軍隊建設；
（8）“壹國兩制”和實現祖國的完全統壹；
（9）國際形勢和對外工作；
（10）加強和改進黨的建設。