壹、性質不同
1、基藥：能夠滿足基本醫療衛生需要，劑型適宜、保證供應、基層能夠配備，國民能夠公平獲得的藥品，藥品銷售業內普遍是指進入國家基本用藥目錄的藥品。
2、普藥：普藥往往指在臨床上已經廣泛使用或使用多年的常規藥品。
二、包括範圍不同
普藥俗稱OTC藥，就是非處方藥，基藥就是基本用藥，包含處方藥和非處方藥。
擴展資料：
國家基藥制度設立的好處：
在發揮有利於保障全體人民健康、有利於規範臨床合理用藥、促進醫保體制改革、有利於正確引導藥物研發的重要作用下，也帶給基藥生產企業進壹步優化和整合市場資源、快速發展的新環境。
加強醫療機構特別是基層醫療機構醫藥衛生人員的繼續教育與培訓，提高合理用藥水平。建立基本藥物使用和合理用藥監測考核評估制度，定期檢查醫療衛生機構基本藥物使用管理情況。針對發現問題，及時采取幹預措施，規範基本藥物的使用。
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