從外形上分辨殲-11B和殲-16還是很容易的，看塗裝就知道，殲-16是解放軍三代機家族中第壹種采用低可視化塗裝的戰鬥機，完全有別於此前戰機的光線色彩塗裝。當然這僅僅是，從外部塗裝角度來辨別。
先來講壹下比較混淆的氣動布局。殲-11B和殲-16都采用的是蘇-27的中央升力體氣動布局設計，兩款機型氣動布局上基本是相似的，沒有太突出的氣動設計差異，只是在局部根據戰機設計要求進行了簡單的改進。比如殲-11B系列戰機機頭保留了“空中拼刺”的空速管，而到殲-16機頭則沒有空速管；另外在機身外部形態上，尤其是駕駛艙後部殲-16明顯要比殲-11B更突出壹些；還有就是翼尖掛架形態，殲-16采用的是類似於蘇-30的翼尖掛架，呈現出圓柱形，而殲-11B及殲-11BS型則是典型的階梯狀翼尖掛架。
從作戰定位上看，殲-11B側重於制空作戰，殲-16則側重的是多用途作戰性能。因而在駕駛艙設計上殲-16采用的是串聯雙座設計，當然殲-11BS雙座型號也采用的是串聯雙座座艙設計，這時怎麽進行分辨呢？
首先看雷達罩的顏色，早期的殲-11以及殲-11B系列戰機除了帶有空速管之外，其雷達罩的顏色多采用黑色，而殲-16則采用的是灰色的雷達罩，另外最近也傳出了壹張白色雷達罩的殲-16戰機。另外，殲-16換裝了國產新型有源相控陣機載雷達，雷達的尺寸也要比殲-11B系列戰機要略大壹些。鑒於最新型號的殲-11B也有白色雷達罩的型號披露出來，因而在雷達罩顏色相同的情況下，主要識別看空速管。
其次，從機頭方向分辨殲-11B、殲-11BS和殲-16還有壹個方法，殲-11B和殲-16看座艙就可以了，前者單座布局，後者串聯雙座。但是殲-11BS也采用的是串聯雙座設計，這是分辨的重點就在於，座艙前部的光電瞄準系統的位置，殲-11B和殲-11BS光電瞄準裝備大都在座艙中央位置，而殲-16的光電瞄準系統則是座艙偏右的位置。
最後，我們再來看發動機。殲-11B系列戰機和殲-16都使用的是國產渦扇-10發動機，但是在細節上略優壹些區別，殲-16使用的是最新的渦扇-10B型發動機。渦扇-10發動機最顯著的特點就是尾噴口呈現出亮銀色，但是殲-16的尾噴口是灰黑色的。