正廳級
“南京海關是受海關總署直接領導,負責指定口岸及相關區域範圍內海關工作運行管理、監督監控的正廳級直屬海關,領導隸屬海關。南京海關管轄範圍為江蘇省的各項海關管理工作,主要負責本關區貫徹落實黨中央、國務院關於海關工作的方針政策和決策部署,負責貫徹執行與海關管理相關的法律、法規、規章、規範性文件和相關技術規範,負責本關區征稅、監管、緝私、出入境檢驗檢疫、統計等工作,負責本關區基層黨組織建設、隊伍建設和日常管理工作。
中華人民***和國在南京口岸設立的進出境監督管理機關
中華人民***和國南京海關（NANJING CUSTOMS DISTRICE P.R.CHINA），簡稱“南京海關”，是中華人民***和國在江蘇省南京口岸設立的進出境監督管理機關，是隸屬於中華人民***和國海關總署的海關，也是中國在長江內河設立的第壹個海關機構?[1]?。
1978年9月23日，中華人民***和國國務院批準在南京設立海關?[2]?；1979年1月1日，中華人民***和國南京海關正式開關?[2]?；2018年4月14日，原江蘇出入境檢驗檢疫局職責和隊伍劃入中華人民***和國南京海關?[1]?。
據2022年2月中華人民***和國南京海關官網顯示，現任關長為吳海平?[17]?。