目 前已知的海洋發光菌只有三屬， 分別是 Vibrio， Photobacterium， 及 Shewanella， 陸地上則有 Xenorhabdus 均為革蘭氏陰性之短桿菌， 普遍地存在於海洋環境及海洋生物體上， 在有氧的自 然環境下， 發光細菌可產生發光酵素， 催化 FM N H 2 及由脂肪酸還原產生的長鏈醛類的氧化反應， 而發出藍綠色的螢光。由於海洋發光細菌發光反應與細菌體內有氧呼吸關系密切， 因此發光細菌之發光 亮度可以反映菌體內的生理狀況， 並可應用作為簡易的環境測試指標。 會發光的生物包括有： 細菌、 真菌、 魚類、 烏賊， 甚至是昆蟲與海藻， 其中有許多是藉由發光菌之存在而發出可見之螢光。 雖然發光菌之棲息地主要是在海洋中， 多與海洋生物行 sym biotic， saprophytic， 或 parasitic 關系， 但在陸地及淡水區域仍有發現其之蹤跡。 其控制發光機之酵素系統乃由 lum inscent sysytem 所控制， 其中包括了負 責發光酵素(lucifrase)產生之lux genes。 發光細菌均為革蘭氏陰性菌， 大部份均有極鞭毛之生理構造， 研究發現， 發光細菌之發光亮度與其細胞密度(cell density)有很大之相關性， 那也道出： 為什麼海洋中有如此多之發光細菌， 而不見其發光， 但在發光生物的發光器中， 卻可發出如斯耀眼之光芒。 這壹個現象可以用壹個發光細菌所含之發光調節機制---lux antoinducer來解釋， 發光菌藉由這個機制， 使其本身對其細胞密度有加以監控之能力。 其原因為： 當發光細菌以 free living 之型態存在於海洋中時， 其所能達到之細胞密度大約只有少於100cells/m L 的量。 所分泌出之 autoinducer也被海水所稀釋而無法達到肉眼所能觀察到之亮度了， 但在特定生物之發光器中， 發光細菌之發光亮度可達 10 10 -10 11 cells/m L， 此時在發光器中 autoinduce 之濃度可達 5-10nM 的量！ 在此臨界濃度以上時， 細菌才會大量的轉錄產生發光酵素之基因， 實導因於高濃度 autoinducer所啟動之發光調節機制。