夏魯寺是西藏較大的佛教寺廟之壹，也是藏傳佛教夏魯派的祖寺。
998年（北宋鹹平元年），西藏佛教進入後弘期，當時佛教徒魯梅·楚臣喜饒等衛藏十人（即：魯梅·楚臣喜繞、章·益西雲丹、熱西·楚臣郡勒、巴·楚臣羅哲、松巴·益西羅哲等前藏五人；洛敦·多傑旺秀、村尊·喜繞僧格、珀東巴·德噶等後藏三人；阿裏俄傑兄弟二人）在朗達瑪禁佛以後，聽說從西藏逃亡到青海的大喇嘛欽·貢巴繞賽（約891～975）是位高僧，便前去拜他為師。
1087年（北宋元祐二年），十人中有壹人叫做洛敦·多傑旺秀的學成回藏，就在日喀則東南的甲措建了壹座寺廟名“堅孔”，收了壹名徒弟叫“吉尊·西繞瓊乃”。吉尊·西繞瓊乃後去印度求學，成為知識淵博的佛學家。為了發展佛教，吉尊·西繞瓊乃欲建寺廟，便請求大師洛敦·多傑旺秋身箭定址，箭落在莊稼剛長出來的青苗地裏，“青苗”，藏語意為“夏魯”，故取名為“夏魯寺”。布頓·仁欽珠（1290～1364）是夏魯派（亦稱“布頓派”）的創始人，他是藏傳教薩迦派中綽浦系的壹位知識淵博的學者，其父勝幢吉祥賢、母福意都是密宗的軌師（阿闍黎）。
1320年（元延祐七年）夏魯寺重建後，布頓·仁欽珠在任住持期間，廣傳四部（事密、行密、瑜伽、無上瑜伽）密法，校訂了大藏經，編有大藏經目錄，其著述有28函***計壹百余部。1322年寫出了《布頓佛教史》 （即“善逝教法源流”），這部歷史著述中壹部分是記述佛教在印度、尼泊爾傳播的史實；另壹部分是記述佛教在西藏及藏族地區的傳播與發殿情況，包括西藏佛教“後弘期”初的歷史；最後壹部分是《甘珠爾》、《丹珠爾》大藏經的總目錄，這是研究西藏佛教史的主要參考書之壹。夏魯寺始建時只有少數僧侶，歷經三次修葺和擴建，僧侶不斷增多，布頓大師任寺主時為鼎盛時期，僧眾達三千多人。
1329年，日喀則地震時夏魯寺遭到毀滅性破壞。當時吉載正在北京，元帝得知夏魯寺毀於地震時即命吉載返藏重新修復，並賜給大量錢財作修復之資。於是吉載從內地請來大批漢族工匠，並運來琉璃磚瓦等物資，於1333年動工，由漢藏工匠合作***同建造了這座具有特殊風格的漢藏混合式結構的寺廟。1333年，在元朝皇帝的大力資助下，布頓大興土木，對原寺加以擴建維修，元朝皇帝給予大量資助，並派去了漢族工匠。重建了這壹規模的寺院。因此這座建築具有濃郁的元代風格，而寺院的墻體和庭院，又都是傳統的西藏風格，屬於典型的漢藏全璧的建築。
1981年和1989年政府先後撥巨款進行了維修，恢復了它原有的風貌和特色。現有僧侶六十多人。