（壹）網上申報。企業登錄“高新技術企業認定管理工作網”（www.innocom.gov.cn），進入企業申報窗口填報並網上提交申報資料。
（二）遞交材料。企業在所報批次規定的截止時間前，將書面申報資料壹式壹份（專項審計報告或鑒證報告須有通過行業網站可查詢的防偽標識編碼、蓋鮮章的原件）遞交至所在區（縣）科技行政主管部門。
企業屬於國家級開發區範圍內的，書面申報資料遞交至國家級開發區管委會科技部門。
（三）區縣初審。科技部門會同同級財政、稅務部門要及時受理申報資料，對企業資格條件、申報資料完整性、專項審計報告或鑒證報告、財務會計報告及中介機構條件等事項進行初審。必要時，可進行現場核查。
（四）區縣推薦。對於初審符合高新技術企業條件的企業，受理申報資料的科技部門會同同級財政、稅務部門聯合出具推薦函（附件3），並將推薦函與企業申報資料紙質件及時報送至市高新技術企業認定管理機構辦公室（市科技局，地址：渝北區新溉大道2號生產力大廈；聯系電話：67788354、67300549）。
（五）組織評審。受理資料後，市高企認定辦公室將適時組織專家，采用集中網評方式進行評審。
（六）實地抽查。對通過專家評審的企業，市高企認定辦公室按照壹定比例篩選抽查企業名單，進行實地現場核查。
（七）認定報備。通過專家評審和實地抽查的企業，按規定即時辦理認定報備手續。