1、名稱不同。中華人民***和國中央軍事委員會，是中華人民***和國最高軍事決策和指揮機關。中國***產黨中央軍事委員會是中國***產黨的最高軍事指揮和軍事決策機構。
2、領導成員的產生、組成不同。中華人民***和國中央軍事委員會，主席由全國人民代表大會選舉或罷免，對全國人民代表大會和全國人民代表大會常務委員會負責。中國***產黨中央軍事委員會，其組成人員由中國***產黨中央委員會決定，由主席、副主席、委員組成。
3、性質不同。中華人民***和國中央軍事委員會，是中華人民***和國最高軍事決策和指揮機關。中國***產黨中央軍事委員會，是中國***產黨的最高軍事指揮和軍事決策機構。