HPV的高危型和低危型是存在區別的。
壹、兩者的消退時間區別：壹般而言，約90%的HPV感染在2年內消退，其消退時間主要由HPV型別決定，低危型HPV需要5～6個月，高危型HPV需要8～24個月。
二、引發的病變區別：HPV——6、11、16、18是感染宮頸最多見的亞型，前兩者是低危型，後兩者是高危型。低危型會引起生殖器疣及低級別外陰、陰道、宮頸鱗狀上皮內病變；高危型則可能引起高級別外陰、陰道、宮頸鱗狀上皮內病變及宮頸癌。
三、分類依據的區別：根據是否造成癌前病變或癌變，將HPV分為低危型和高危型，低危型HPV會導致尖銳濕疣、皮膚扁平疣等良性病變，高危型HPV則會導致外陰、陰道、宮頸、陰莖、肛門、口腔或消化道等部位發生癌前病變甚至進展為癌。
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