短尾猴、獼猴、藏酋猴、穿山甲、豺黑熊、小熊貓、石貂、黃喉貂水獺 、小爪水獺、斑林貍、大靈貓、小靈貓、草原斑貓、荒漠貓、叢林貓、猞猁、兔猻、金貓、漁貓、河麂、馬鹿（包括白臀鹿）、水鹿駝、鹿斑羚、藏原羚、鵝喉羚、鬣羚、黃羊盤羊、巖羊海南兔、雪兔、塔裏木兔、巨松鼠、鰭足目（所有種）、鯨目（除壹類外其它鯨類)、草原狼、吡啶獸
爬行類
平胸龜、三線閉殼龜、綠海龜、凹甲陸龜、雲南閉殼龜、嫡龜、大壁虎、山瑞鱉、地龜、太平洋麗龜、玳瑁、棱皮龜
兩棲類
貴州疣螈、大涼疣螈、細痣疣螈、鎮海疣螈、細瘰疣螈、虎紋蛙
魚類
江 豚
黃唇魚、松江鱸魚、克氏海馬魚、胭脂魚、唐魚、金線鲃、大理裂腹魚、花鰻鱺、川陜哲羅鮭、秦嶺細鱗鮭、文昌魚、大白鯊、鯨鯊
鳥類
國家二級保護動物--鷹(6張)
角?、赤頸?、鵜鶘（所有種）、鰹鳥（所有種）、海鸕鶿、巖鷺、海南虎斑鳽、小葦鳽、彩鸛、白鹮、白琵鷺、黑臉琵鷺、紅胸黑雁、白額雁、天鵝（所有種） 、隼科（所有種） 、鷹科（除壹類外其它鷹類）、黑琴雞、柳雷鳥、巖雷鳥、雪雞血雉、紅腹角雉、藏馬雞、藍馬雞、原雞勺雞、白冠長尾雉錦雞（所有種） 、灰鶴、蓑羽鶴、長腳秧雞、姬田雞、棕背田雞、花田雞、小青腳鷸、灰燕鸻、小鷗、黑浮鷗、黃嘴河燕鷗、黑腹沙雞綠鳩（所有種） 、黑頦果鳩皇鳩（所有種） 、斑尾林鴿、鴉鵑（所有種） 、鸮形目（所有種）、灰喉針尾雨燕、鳳頭雨燕、橙胸咬鵑、黑胸蜂虎、綠喉蜂虎、犀鳥科、白腹黑啄木鳥、闊嘴鳥、鶴嘴翠鳥、鸚鵡科（所有種）、小杓鷸、白枕鶴、花尾榛雞、黃嘴白鷺、彩鹮白鷴、黑頸鸕鶿、八色鶇科（所有種） 、黑鹮、藍耳翠鳥、鵑鳩（所有種） 、黑嘴端鳳頭燕鷗、銅翅水雉、沙丘鶴、黑鷴、鐮翅雞、鴛鴦、蛇雕。
無脊椎動物
虎斑寶貝、冠螺、大珠母貝、佛耳麗蚌、偉鋏叭、尖板曦箭蜓、寬紋北箭蜓、中華缺翅蟲、墨脫缺翅蟲、拉步甲、碩步甲、彩臂金龜（所有種）、叉犀金龜、雙尾褐鳳蝶、三尾褐鳳蝶、中華虎鳳蝶、阿波羅絹蝶