眾所周知，今年動視對於《使命召喚9》采用了他們自己的原創劇情，包括什麽中美冷戰、明暗兩條線，還有僵屍劇情之類的，看上去非常的復雜。其實說白了，其實蠻簡單的，這壹代的劇情其實還是承接了上壹代《黑色行動1》裏的劇情，主要分為兩條，壹條是1980年，梅森（黑色行動1的男主角）和哈德森救出了伍茲（黑色行動2裏的老伍茲），三人後到中東與中國人合作執行任務，任務中發現了克拉夫琴科，後來被伍茲殺了，打敗了勞爾·梅南德斯；第二條則是2025年梅森兒子同樣來到中東地區，然後得到了當年與梅森合作的那個中國人找天的幫助，打敗勞爾·梅南德斯，並回到美國，成功救出總統的故事。至於中美冷戰神馬的其實都是浮雲，只是作為故事背景以及梅南德斯興風作浪時利用的條件。
總結下：
主線裏講述的就是老梅森與大反派梅內德斯之間的故事，壹***會有三種結局：兩者各死壹個或者都死了，然後梅森兒子和老伍茲壹起去拜祭他。
支線：
1.Karma是電腦高手，也就是他破解了令很多人頭疼的病毒（Cordis Die制造）；
2.趙天是阻止SDC派無人飛機去救奧巴馬號的關鍵（趙天師站在梅森這邊了）；
3.Farid是Salazar背叛的時候，為Karma擋槍的。
4.Brigge是奧巴馬號的指揮，而奧巴馬號是美軍的主要戰鬥力（因為會有解放軍沖進華盛頓的劇情）。
總體來說，就是梅南德斯是壹個大壞蛋，不停地制造事端，包括在2025年利用中美之間的沖突去滅亡美國（沒成功），然後被父子兩代打敗的故事。