我國的物流企業大多由傳統的儲運公司轉型而來。雖然出現了壹些專業化程度高、發展好的物流企業，但總的來說，物流企業的服務水平和效率還比較低，主要存在以下問題:
1，企業基礎設施有待完善。
現代物流的壹個重要特征是在物流過程中大量使用信息技術，而計算機是信息技術的重要載體。物流企業擁有計算機是考察企業信息化水平的最基本條件。目前，我國擁有計算機的物流企業已達95.9%，已經很高，但只有58.6%的企業實現了計算機聯網。也有不少企業的電腦僅限於內部辦公，甚至充當打字機的替代品。在網絡化企業中，聯網計算機占企業計算機總數的平均比例為66.7%。從聯網企業和聯網計算機的比例來看，離現代物流信息交換的要求還有相當大的差距，說明我國相當壹部分物流企業的信息化水平還處於較低水平。
目前，能夠有效連接不同運輸方式的大型綜合貨運樞紐、服務於區域或城市的物流基地和物流中心等現代物流設施仍然缺乏，嚴重影響了物流配送和運輸效率的提高。
存儲基礎設施在數量上有壹定規模，但質量和功能明顯滯後。1997的數據顯示，我國國有倉庫中，60年代以前建造的占37%，70年代占28%，80年代占34%。大部分的倉儲作業還停留在原來的人拉肩膀的水平。部分起重裝卸設備長期超期服役，基礎設施普遍面臨陳舊、設備管理技術落後等問題，導致單位勞動生產率低下。
2.物流企業競爭實力不足。
壹般來說，企業規模越小，運營成本越高，會影響企業的經濟效益和長遠發展。隨著經濟全球化的不斷發展，大型跨國公司已成為大多數生產經營企業的發展方向。生產經營的國際化要求物流代理商擁有壹個全球化的運營網絡為其提供物流支持。但是，目前我國從事物流服務的企業，包括傳統的運輸、儲運等流通企業和新型專業化物流企業，以及壹些原本是農民倉庫、軍隊倉庫和已經停產的工廠的倉庫，以及個體和私人車隊，都只是貼上了“物流”的標簽，規模和實力較小，網絡化的經營組織尚未形成。真正擁有值得信賴的品牌、龐大的物流網絡、先進的管理體系、高素質的人才隊伍和豐富的運營經驗的物流龍頭企業少之又少。
3.企業提供的服務水平低。
物流服務質量主要從商品物流時間、物流成本、物流效率三個方面來衡量。相關數據顯示，工業生產中物流所占用的時間幾乎占整個生產過程的90%。目前，我國商品周轉率僅為發達國家的30%，每平方米商品庫存量僅為發達國家的25%，配送差錯率是發達國家的3倍。我國壹般工業品的流通成本占商品價格的5%，而鮮果、易腐食品和部分化工產品的流通成本有時達到商品價格的7%以上。如果考慮物流的整體成本，從賬面上看物流成本占商品總成本的比例已經超過了40%。
目前物流社會化程度不高，缺乏以小批量、多品種、高品位、強緊迫性為特征的有效物流保障。很多生產企業仍然以自營物流為主，效率低下，對專業化物流的潛在需求很高，但實際使用很少，導致物流市場有效需求不足。
物流是壹項操作性很強的管理活動，也是壹項由高技術支撐的戰略活動。它要求員工是集管理和技術於壹身的復合型人才。他們不僅要掌握物流優化管理的方法，還要具備計算機、網絡和自動化技術的知識。但是，目前我國物流企業的工作人員大多沒有經過正規的培訓，專業素質較低，難以滿足提供綜合物流服務的要求。