最後神樹與天神消失，人類失去了神之力，壹味的依靠樹神對抗天神的日子終有盡頭，最後還是要依靠自己的雙手開創未來。這也正是動畫想向我們傳達的。這部動畫正是對人類信念，毅力，靈魂的贊揚與傳唱。?
縱使《結城友奈是勇者》的結局是Happy Ending，但這個故事的展開也充滿了令人抹淚的悲劇色彩。少女們間的友情無比堅定，少女們的夢想甜蜜而美好，少女們守護世界的勇氣令人稱頌，但這壹切美好的背後，卻有著無比沈痛的代價。
故事介紹
贊州中學二年級的元氣少女結城友奈，在加入了名為“勇者部”的社團後，每天和好友們壹起幫助各種有困難的人。
但在某壹天上課時，友奈和“勇者部”的夥伴們突然發現，自己周圍的時間停止了。隨即，她們被轉移到了壹個華麗的“裏側”世界，“勇者部”部長犬吠埼風告訴友乃等人，她們被守護世界的“神樹”選為了真正的勇者，並獲得了神樹的力量。
她們必須打敗不斷來犯的“Vertex”，才能守護住這個美麗的世界。因此，壹段結合了友情、成長，以及變身戰鬥的壯麗篇章就此拉開了序幕。