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DBSCAN聚類算法

DBSCAN(Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise,具有噪聲的基於密度的聚類方法)是壹種很典型的 密度聚類算法 ,和K-Means,BIRCH這些壹般只適用於凸樣本集的聚類相比,DBSCAN既可以適用於凸樣本集,也可以適用於非凸樣本集。DBSCAN算法的顯著優點是聚類速度快且能夠有效處理噪聲點和發現 任意形狀的空間聚類 。

該算法利用基於密度的聚類的概念,即要求聚類空間中的壹定區域內所包含對象(點或其他空間對象)的數目不小於某壹給定閾值。過濾低密度區域,發現稠密度樣本點。同壹類別的樣本,他們之間的緊密相連的,也就是說,在該類別任意樣本周圍不遠處壹定有同類別的樣本存在。

DBSCAN密度定義:DBSCAN是基於壹組鄰域來描述樣本集的緊密程度的,參數? (?, MinPts)? 用來描述鄰域的樣本分布緊密程度。其中, ? 描述了某壹樣本的鄰域距離閾值, MinPts? 描述了某壹樣本的距離為?的鄰域中樣本個數的閾值。

從上圖可以很容易看出理解上述定義,圖中MinPts=5,紅色的點都是核心對象,因為其?-鄰域至少有5個樣本。黑色的樣本是非核心對象。所有核心對象密度直達的樣本在以紅色核心對象為中心的超球體內,如果不在超球體內,則不能密度直達。圖中用綠色箭頭連起來的核心對象組成了密度可達的樣本序列。在這些密度可達的樣本序列的?-鄰域內所有的樣本相互都是密度相連的。

由密度可達關系導出的最大密度相連的樣本集合,即為我們最終聚類的壹個類別,或者說壹個簇。這個DBSCAN的簇裏面可以有壹個或者多個核心對象。如果只有壹個核心對象,則簇裏其他的非核心對象樣本都在這個核心對象的?-鄰域裏;如果有多個核心對象,則簇裏的任意壹個核心對象的?-鄰域中壹定有壹個其他的核心對象,否則這兩個核心對象無法密度可達。這些核心對象的?-鄰域裏所有的樣本的集合組成的壹個DBSCAN聚類簇。

1、DBSCAN發現簇的過程

?初始,給定數據集D中所有對象都被標記為“unvisited”,DBSCAN隨機選擇壹個未訪問的對象p,標記p為“visited”,並檢查p的 ?- 領域是否至少包含MinPts個對象。如果不是,則p被標記為噪聲點。否則為p創建壹個新的簇C,並且把p的 ?- 領域中所有對象都放在候選集合N中。DBSCAN叠代地把N中不屬於其他簇的對象添加到C中。在此過程中,對應N中標記為“unvisited”的對象 P'?,DBSCAN把它標記為“visited”,並且檢查它的 ?- 領域,如果 P' 的 ?- 領域至少包含MinPts個對象,則P' 的 ?- 領域中的對象都被添加到N中。DBSCAN繼續添加對象到C,直到C不能擴展,即直到N為空。此時簇C完成生成,輸出。

?為了找到下壹個簇,DBSCAN從剩下的對象中隨機選擇壹個未訪問過的對象。聚類過程繼續,直到所有對象都被訪問。

還需考慮三個問題:

第壹個是壹些異常樣本點或者說少量遊離於簇外的樣本點,這些點不在任何壹個核心對象在周圍,在DBSCAN中,我們壹般將這些樣本點標記為噪音點。DBSCAN算法很容易檢測異常點。

第二個是距離的度量問題,即如何計算某樣本和核心對象樣本的距離。在DBSCAN中,壹般采用最近鄰思想,采用某壹種距離度量來衡量樣本距離,比如歐式距離。這和KNN分類算法的最近鄰思想完全相同。對應少量的樣本,尋找最近鄰可以直接去計算所有樣本的距離,如果樣本量較大,則壹般采用KD樹或者球樹來快速的搜索最近鄰。

第三種問題,某些樣本可能到兩個核心對象的距離都小於?,但是這兩個核心對象由於不是密度直達,又不屬於同壹個聚類簇,那麽如果界定這個樣本的類別呢?壹般來說,此時DBSCAN采用先來後到,先進行聚類的類別簇會標記這個樣本為它的類別。也就是說BDSCAN的算法不是完全穩定的算法。

2、DBSCAN算法流程

優點:

和傳統的K-Means算法相比,DBSCAN最大的不同就是不需要輸入類別數k,當然它最大的優勢是可以發現任意形狀的聚類簇,而不是像K-Means,壹般僅僅使用於凸的樣本集聚類。同時它在聚類的同時還可以找出異常點,對數據集中的異常點不敏感。壹般來說,如果數據集是稠密的,並且數據集不是凸的,那麽用DBSCAN會比K-Means聚類效果好很多。如果數據集不是稠密的,則不推薦用DBSCAN來聚類。

缺點:

1、如果樣本集的密度不均勻、聚類間距差相差很大時,聚類質量較差,這時用DBSCAN聚類壹般不適合。

2、調參相對於傳統的K-Means之類的聚類算法稍復雜,主要需要對距離閾值?,鄰域樣本數閾值MinPts聯合調參,不同的參數組合對最後的聚類效果有較大影響。壹般這兩個參數的確定靠經驗值。如果覺得經驗值聚類的結果不滿意,可以適當調整?和MinPts的值,經過多次叠代計算對比,選擇最合適的參數值。如果MinPts不變,?取得值過大,會導致大多數點都聚到同壹個簇中,?過小,會導致壹個簇的分裂;如果?不變,MinPts的值取得過大,會導致同壹個簇中點被標記為離群點,?過小,會導致發現大量的核心點。

3、不適合高維數據,可以先進行降維操作

4、Sklearn中效率很慢,可以先執行數據削減策略

可視化演示的網址

參考文章

劉建平