壹、收錄情況不同
維普收錄最久，萬方收錄時間最短，但是現刊萬方收錄最好，維普很多期刊都沒有了，特別是醫學類的。
二、檢索結果
中國知網的結果最多，維普第二，萬方最少。
三、歸類方式不同
中國知網能按照年份、來源數據庫、文獻出版來源、作者、研究層次、基金資助、中文關鍵詞、作者單位等對所獲得的文獻進行歸類分析，維普能按照全部期刊、核心期刊、CSSCI期刊、近五年期刊文獻、近三年期刊文獻和近壹年期刊文獻對所獲得的文獻進行歸類分析，萬方能按照論文類型、年份、期刊和學術類別對所獲得的文獻進行歸類分析。
四、覆蓋範圍
萬方：自然科學、數理化、天文、地球、生物、醫藥、衛生、工業技術、航空、環境、社會科學、人文地理等各學科領域。
維普：自然科學專輯、農業科學專輯、醫藥衛生專輯、教育科學專輯、經濟管理專輯、圖書情報專輯、工程技術專輯。
知網：自然科學、人文社會科學及工程技術各領域知識，擁有期刊、報紙、博碩士培養單位的博士和優秀碩士學位論文、全國重要會議論文。