1、覆蓋範圍不同：
每個壹級學科根據實際學科的內涵覆蓋分為若幹二級學科或專業，即壹級學科內包含二級學科。
比如壹級國家重點學科哲學包含二級國家重點學科馬克思主義哲學、中國哲學、邏輯學、倫理學、宗教學和科學技術哲學，壹級學科理論經濟學包含二級學科政治經濟學、經濟思想史、西方經濟學和世界經濟。
2、各學科數目不同：
到2007年為止，我國***組織了三次評選工作，***評選出全國286個壹級學科國家重點學科、677個二級學科國家重點學科、217個國家重點（培育）學科，其中壹級學科國家重點學科所覆蓋的二級學科均為國家重點學科。
第壹次評選工作是在1986-1987年，***評選出416個重點學科點，其中文科78個，理科86個，工科163個，農科36個，醫科53個，涉及108所高等學校。
第二次評選工作是在2001-2002年，***評選出964個高等學校重點學科。
第三次評選工作是在2006年，即現今的國家重點學科。
擴展資料：
國家重點學科應具備的基本條件：
1、學科方向：對推動學科發展、科技進步，促進我國經濟、社會、文化發展和國防建設具有重要意義；
2、學術隊伍：有在所在學科學術造詣高、有壹定國際影響或國內公認的學術帶頭人，有結構合理的高水平學術梯隊；
3、人才培養：培養博士生的數量和質量於全國同類博士點前列；
4、科學研究：已形成有較大影響的學術特色，取得壹定數量較高水平的研究成果，對經濟建設和社會發展作出重大貢獻，且承擔具有重要理論和現實意義的研究項目；
5、條件建設：教學、科研條件居全國同類學科先進水平，具有較強的與相關學科相互支撐的能力和獲取國內外信息資料的先進手段；
6、學術氣氛濃厚，國際、國內學術交流活躍。
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