內容如下：
政府正在實行的特別獎勵制度——“資優制度”是為培養國家級天才而設立的制度。壹旦潛力獲得認可，被此制度選中的學生會得到“超高校級”的稱號，並且學生會被授予獎學金等各種特權，肩負著人類的未來。“超高校級的鋼琴家”赤松楓便是其中壹人。
擁有超高中級才能的學生原本散布在全國各地，通常也不會有機會齊聚壹堂。可是某天，包括楓在內的16名超高中級的學生被壹並監禁在了“才囚學園”內。自稱是校長的神秘玩偶“黑白熊”以及它的孩子們“小黑白熊”支配著才囚學園。黑白熊將這所學園稱為“讓才華橫溢的高中生們通過自相殘殺，競爭誰是第壹的地方”。
黑白熊又聲稱學園中有壹個瘋狂的規定。在發生殺人事件後，將會召開班級審判，討論“誰是殺人兇手”。如果找出真兇，僅會有兇手受罰；如果發生錯判，則只有兇手可以幸存，所有剩余的清白的學生都會受到懲罰。學園被巨大的壁壘包圍，想要逃離那裏幾乎不可能。脫身的唯壹辦法，就是按照黑白熊所說，與其他學生自相殘殺。
為了結束廝殺、為了守護重要的人，以“謊言”揭穿“真相”的班級審判就此開幕。
在《新彈丸論破V3》中，遊戲的男女主角都塑造的非常立體，即使是早早退場的配角們，故事演出也毫不遜色。出色的角色設定掩蓋了部分章節犯案動機和殺人手法上的不佳表現，第5章之前的遊戲幾乎可以稱得上“彈丸論破”的完全體。
但絕望制作團隊顯然在考慮是否把這種不斷自相殘殺的劇情無限循環下去。在平衡玩家需求和追求遊戲突破的道路上，他們決定把問題擺在所有《新彈丸論破V3》玩家的面前，讓大家壹起做出決斷。這壹舉動突破了以往的“遊戲”的遊戲規則，是無比大膽的壹步，恐怕也只有象征壹種極端的“彈丸論破”敢於做出如此嘗試，自然也怪不得部分玩家對這次新作的嗤之以鼻。