由於種種原因，自發形成的家庭旅館存在問題比較突出。主要表現在：
（壹）家庭旅館普遍檔次較低、特色不突出、服務不能規範。
（二）有特色的家庭旅館數量少，如何打造高品位、功能齊全，有壹定規模的家庭旅館品牌產品，仍有得進壹步的探索和實踐
（三）對家庭旅館的管理、協調、疏導以及宣傳推介仍有許多不足。
（四）發展有特色家庭旅館、受資金及配套設施制約。 在家庭旅館發展工作中，首先必須重視建設規範化。其中主要環節是以下四個方面：
1、衛生間。家庭旅館壹般位於農村，農民對於衛生間的衛生要求往往達不到遊客的標準，需要進行改造，並加強衛生管理。例如，藏族的衛生間是傳統的蹲式，沒有沖水設備，糞便從二樓直接露天下落到壹樓，在壹樓自然堆積，難以滿足遊客對衛生狀況的要求。在林芝家庭旅館規劃設計中，廣東省旅遊發展研究中心對其進行了改造，增加沖水和排汙管道，使遊客能夠接受。
2、通水通電：壹些村落的自來水管道尚未建成，往往用山溪水或井水，水質衛生得不到保證。家庭旅館的建設首先要完善基礎設施，鋪設供水管道。
3、床鋪。各地的床鋪各不相同，我們認為沒有必要統壹，但是對於床鋪的結實、平整、衛生、舒適四個方面不能馬虎。睡在北方的炕上、睡在南方古鎮的老式大床上都能夠增加遊客的興奮感。在家庭旅館規劃建設中，我們提倡被褥用有地方特色的花布，在窗戶和家具方面增強地方文化氣息。
4、公***活動場所。家庭旅館客人需要與居民交流，與***同住宿的遊客交流。家庭旅館往往也難以做到每個房間都有電視，所以需要有壹個公***活動場所。這個場所壹般與餐廳在壹起。在陽朔和拉薩、麗江，這個公***場所是酒吧。在林芝的家庭旅館，這個場所是二樓的大廳，旅遊者可以與藏民壹起用餐，看藏民打酥油茶、做糌粑，馬上品嘗酥油茶和糌粑，還可以壹起看電視、打撲克牌、下棋，交流旅遊經歷。
5、標準圖則和審定標準。
壹般群眾對於如何改造出壹個家庭旅館沒有經驗，政府應給予壹定的指導。例如，房間和床位的大小如何適應遊客的習慣。標準圖則的出臺十分必要。在林芝家庭旅館建設規劃中，廣東省旅遊發展研究中心制定了三個標準圖則，指導當地群眾改造和新建家庭旅館。對於申報營業的家庭旅館，當地旅遊主管部門也可以對照圖則進行審定，確定其是否可以成為家庭旅館協會的壹員。 建設是壹時的，管理是長期的。家庭旅館的健康發展，需要政府加強管理。
1、首先，要讓家庭旅館合法經營。稅收、工商、衛生等部門要提前介入，預先審核登記、年審，辦理有關證照。
2、其次，要建立家庭旅館協會，負責進入審核許可和日常管理，各家庭旅館也通過協會交流信息，提高水平。國外家庭旅館的發展較為成熟，英國、法國、加拿大等國的家庭旅館已經基本形成網絡，信息、中介宣傳、預訂等都十分方便。以家庭為單位進行經營、自己招徠客源是很難的，協會可以收取會費，編印壹些小冊子，組織壹些宣傳活動，開拓遊客市場。廣東南昆山旅遊區成立了“旅遊協會”和“個體勞動協會”兩個機構，對家庭旅館進行協調管理，同時制訂了管理規定和協會章程，使各成員單位守法經營和行業自律。
3、第三，要統壹家庭旅館的徽標和形象。這主要是規範市場秩序，便於開拓市場，讓旅遊者住得放心。廣東省旅遊發展研究中心建議林芝地區家庭旅館采用“家”的漢藏雙語言藝術字徽標。遊客如果在路口就可以看到家庭旅館的招牌隨風飄揚，也就知道歇腳之地已經不遠。
4、最後，在家庭旅館集中的村落要建立“接待中心”，起到管理中心的作用，處理遊客投訴，解決拉客問題，集中洗衣、救護，同時可以解決遊客的基本的購物需求。