分不同地區，海關進口增值稅發票有的是需要稅務先稽核比對成功後才可以抵扣，這樣壹般當月抵扣不了，還有就是可以直接申報抵扣，這種方式可以當月就抵扣了。
報稅的時候，會將這個信息導入到申報系統裏，系統識別出來就可以抵扣了。把海關票的數據填進申報表就行了，其他跟普通申報沒什麽區別。
根據《國家稅務總局關於加強海關進口增值稅專用繳款書和廢舊物資發票管理有關問題的通知》（國稅函[2004]128）附件1《海關進口增值稅專用繳款書稽核辦法》的規定：
增值稅壹般納稅人取得的2004年2月1日以後開具的海關完稅憑證，應當在開具之日起180天後的第壹個申報期結束以前向主管稅務機關申報抵扣，逾期不得抵扣進項稅額。
擴展資料：
進口增值稅計算方法
我國稅法規定，納稅人進口貨物，按照組成計稅價格和規定的增值稅稅率計算應納稅額，不得抵扣任何稅額（在計算進口環節的應納增值稅稅額時，不得抵扣發生在我國境外的各種稅金）。組成計稅價格和應納稅額計算公式為：
組成計稅價格=關稅完稅價格+關稅+消費稅
應納稅額=組成計稅價格x稅率
需要註意的是，進口貨物增值稅的組成計稅價格中已包括已納關稅稅額，如果進口貨物屬於消費稅應稅消費品，其組成計稅價格中還要包括進口環節已納消費稅稅額。
進口增值稅計算公式 : 進口增值稅=（關稅完稅價格+關稅）/（1-消費稅率）×增值稅率
參考資料：
百度百科-進口增值稅參考資料：
百度百科-稅收通用繳款書