京交通大學研究生院主要專業如下：新聞傳播學數學物理學生物學系統科學統計學力學機械工程光學工程材料科學與工程動力工程及工程熱物理電氣工程電子科學與技術。
北京交通大學是教育部直屬大學。1981年，北京交通大學成為中國首批博士、碩士學位授予權授予單位之壹。學校擁有21個壹級學科博士學位授權點，35個壹級學科碩士學位授權點，10個專業學位授權點，其中工程碩士學位授權點招收和培養21個工程專業碩士研究生。
各學科在人才培養和科研方面都有較強的實力。現有國家壹級重點學科2個，國家二級重點學科2個，省部級重點學科3個，省部級重點學科10個，省部級跨學科重點學科2個。現有博士生導師359人，碩士生導師880人，其中國務院學科評議組成員5人。