前期籌備階段
除做好與使用常用繪
畫材料所制作的片種相類似的籌備工作以外，還應繪制偶的造型設計圖稿交付偶制作車間試制，其中需要考慮到偶的骨架、關節、內部、外皮等制作材料，關節設定等工藝；將布景設計圖稿交給場景制作車間制作所需的場景；偶動作操作人員作影片角色分析、設計動作節奏，分場排戲後開始試拍；完成包括人物道具測試，拍攝設備性能檢測以及特技等的各種技術實驗。
拍攝階段
檢查開拍前的準備工作，包括角色、布景、燈光、動作、攝影等各部門工作，以便按拍攝日程正式投拍。每場戲的拍攝按照分鏡頭畫面臺本，由美工人員布置場景，攝影人員確定鏡頭地位和布光，導演復對拍
定格動畫拍攝
攝內容，動作人員按照劇情操縱偶表演，場記記錄鏡號、景別、對白和動作內容，填寫拍攝表。每拍攝完壹批底片即交送洗印部門沖洗並印出工作樣片，或置入計算機中進行鏡頭檢查工作。
後期制作階段
從剪輯工作樣片，配錄對白、音樂、音響效果以及進行混合錄音，直到聲畫合成、輸出完成拷貝等，與其它片種大體相同。
由於定格動畫所囊括的各類片種所使用的制作材料的不同，它們的制作流程也各不相同。主要的不同點表現在籌備階段，其次在拍攝階段，而後期制作階段的工序都是相同的。