1、說明部分
說明委托方名稱（被審計企業名稱）及委托目的（審計目的）；說明會計責任、審計責任、審計依據。
2、企業及項目基本情況
企業基本情況，包括：公司名稱、註冊日期、營業執照頒發機構、註冊號碼、註冊資本，法定代表人、公司住所，經營範圍以及簡述項目情況。
3、基金項目合同及相關規定
項目申報時間、項目名稱、合同簽訂時間、立項代碼、取得創新基金資助金額及資助方式；項目投資總額；創新基金用途；項目合同規定的各項經濟指標情況。
4、合同執行期間項目各項經濟指標完成情況
資金到位情況；資金支出情況；項目各項經濟指標完成情況。
5、報告附註
會計政策註釋；企業適用稅種及稅率；主要財務指標註釋。