1、培養的能力不同。應用化學專業培養具備運用所學知識和實驗技能進行應用研究、技術開發和科技管理的基本技能。化學專業學生主要學習化學方面的基本知識、基本理論和基本技能與方法，受到科學思維和科學實驗的訓練，具有壹定的科學研究、應用研究及科技管理的能力。
2、層級不同。化學專業是壹種大學專業，應用化學是二級學科。應用化學是壹級學科化學工程與技術下設的二級學科。化學專業是壹種大學專業。化學專業培養具備化學的基礎知識、基本理論和基本技能。
3、就業率不同。應用化學專業就業率高，化學專業就業率低。應用化學專業的畢業生壹次性就業率比較高，就業行業包括教育、材料、軍工、汽車、軍隊等。化學專業因畢業難以找到對口工作單位，工資低，工作環境差，勞動強度大等，已成為紅牌專業。