易性病發病的原因十分復雜，不少環節還無法解釋，至今仍停留在觀察和研究階段，據推測可能與下列因素有關。
⒈遺傳因素 壹般認為遺傳因素可能與易性病發生有關，但尚無充分資料能加以證明。曾有2例雙胞胎，其中哥哥健康正常，弟弟患有嚴重易性病，而父母身體健康，其他兄弟精神亦無異常。
⒉內分泌因素 有學者報告血漿中睪酮水平在易性病中男性患者偏低，女性患者偏高。亦有人認為男女易性病患者血漿中睪酮均無明顯變化。在筆者接觸的病例中，術前術後血漿睪酮水平有改變，但癥狀並沒有隨睪丸和卵巢的被切除而消失，可見根源不在於此，性激素水平的差異並非易性病發生的原因。
⒊外生殖器大小與形態 由於外生殖器與性身份有著密切關系，有人估計外生殖器的大小及形態與易性病的發生有關。但在筆者目前的資料中，還未發現有男性易性病患者性器官大小、形態異常，以及女性易性病患者的外陰畸形（如陰蒂肥大等）。
⒋環境和心理因素 人們習慣上認為，產生易性病的原因是父母對幼小兒女按異性打扮或撫養，或患者在異性人群中成長。女性易性病患者可因為對男性剛強性格和獨立生活能力的崇拜而產生對男性性別的向往，這在病例中也確實有所發現。然而，不少演員壹生扮演女角，卻從來沒有改變他們對自身男性性別的認同；有些兩性畸形患者，雖從小被切除睪丸、陰莖，並按女孩打扮撫養，似乎已成為“真正”女性，但在青春期並未出現女性特征，而在了解自己的身世後，最終仍要求恢復男性。
⒌性別中樞功能異常 有學者認為，決定性別的中樞在下丘腦。至青春期，下丘腦會使人體向既定的性別發育成熟。由於下丘腦的功能受制於染色體上的性基因，性基因的啟動，才是表現性別的真正原因，而性基因的選擇，在卵子受精的瞬間已決定。筆者認為，易性病的產生並不僅僅是由於心理變異，它還應該有生物學因素的作用，深入的研究有可能為此找到證據。