1、毒性不同
未制馬錢子的毒性比制馬錢子的毒性大，制馬錢子在炮制的過程中降低了毒性。
2、服用方式不同
未制馬錢子只能外用，不能內服；制馬錢子可以少量內服。
3、功效上有區別
生馬錢子：功能與主治：通絡止痛，散結消腫。用於風濕頑痹，麻木癱瘓，跌撲損傷，癰疽腫痛；小兒麻痹後遺癥，類風濕性關節痛。
制馬錢子：活血通絡、消炎抗菌、止痛、祛瘀生肌。
補充：制馬錢子為馬錢科植物雲南馬錢的幹燥成熟種子。馬錢子的主要成分是士的寧，臨床上有降低“血沈”及“抗O”的作用。
生馬錢子，為馬錢科植物馬錢Strychnosnux-vomicaL.的幹燥成熟種子。冬季采收成熟果實，取出種子，曬幹。
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