蛋白質免疫印跡（Western Blotting）：檢測泛素化蛋白酶體系統的方法，主要是通過檢測蛋白樣品中特定靶蛋白的泛素修飾水平，來間接判斷細胞內的泛素化水平和蛋白降解水平。
穩定同位素標記技術：利用蛋白表達水平之間的穩定同位素標記（如氘代謝物）來進行定量分析的技術。通過對比同位素標記的樣品和對照樣品，可以精確地測定蛋白酶體下降解的蛋白數量和泛素化的程度。
熒光探針技術（Fluorescent Probes）：基於熒光分子的檢測技術，通過將熒光探針與泛素或者廢棄蛋白質相連，來直接觀察和定量細胞內泛素化水平的變化。
免疫卡（Immunoprecipitation）：結合免疫學和化學分析的檢測方法，通過選擇性地捕獲泛素化的蛋白或者其互作伴侶，並使用質譜技術對其進行鑒定和分析。
以上幾種方法都可以用於檢測泛素化蛋白酶體系統，並根據不同實驗需要選擇不同的方法。