電影《大魚海棠》講述的主要內容如下：
在壹個與人類世界不同的地方，那裏生活的人們掌控著人類世界的各種事物，比如女主角椿掌握著海棠樹、男主角湫掌控著人間的風雨，還有水火雷電等等等等。但是呢，那裏的人在成年之時都會化作紅色的海豚，去到人間學習或者是遊歷，當然也不乏有人留在了誘惑頗多的人間沒有回來。
這年女主椿成年了，她和壹同成年的小夥伴踏上了旅途，化為海豚的日子裏，他們可能是安全的，但是在人間也可能是危險的，就在他們見識了人間的景物與人以後，遊歷的最後壹個晚上，女主被漁網困住了，這時男主也就是後來的鯤救下她，而自己卻喪失了性命，只留下可愛的妹妹獨自活在人間。
女主回家以後內心不安，尤其是想到那個小妹妹的時候，由於在人間死去的好人都會化作小魚來到靈婆那裏，於是她來找到靈婆，用自己壹半的壽命換回了男主的靈魂，並且好生照料。在這個過程中，女主從小的玩伴湫壹直陪伴著她，保護著她和鯤，直到鯤長出翅膀。為了把鯤送回人間，他們打通了與人類世界的通道，結果海水倒灌，村子面臨滅頂之災，他們倆壹起努力保護村子，又盡力把鯤送回去。
但是天命難違，靈婆說鯤的性命終究還是要壹個人來換，這個時候，深愛著椿的湫，為了自己愛的那個人，選擇放棄自己的性命。結局裏，椿把鯤帶回了人間，而且村子又恢復了平靜，只是湫卻再也沒回來。但在最後的彩蛋裏，湫還是被靈婆帶了回去，應該還可以死而復生吧。
當然這只是想象，故事大致就這樣啦！