1.培養前的準備工作
（1）各構築物建成，並經清池清除建築垃圾，靜壓試驗證明無滲漏，無下沈位移，最後按有關規程驗收合格。
（2）電器、機械、管路等全部設備建成並經單機試車、聯動試車正常。最後按有關規程（說明書）驗收合格。
（3）根據日後運行管理需要，有條件的汙水處理廠（站）需進行最基本的常規化驗測試，如pH、水溫、COD、生物相等，用以指導活性汙泥的培養過程和日常運行。
（4）基礎數據的調查摸底，包括汙水流量晝夜變化情況，水質（pH、水溫、COD、含氮、含磷、有毒物質等）及其變化情況，各種設施和設備的技術參數。有條件的地方最好對受納水體(如接納排汙的河流等)本底水質調查備案，以便考察若幹年後對受納水體的影響提供依據。
（5）根據處理水質狀況備足必需的營養物(碳源、氮源、磷源)，以備缺什麽補什麽。采用接種培菌法還需備足汙水性質相似其他汙水處理廠（站）的幹（或濃縮）汙泥作為活性汙泥微生物培養用的菌種。
（6）操作人員應熟悉整個系統的管道布置和公用工程方面的情況，了解汙泥培養的基本過程和控制要求。
（7）人員到位，自培養和馴化後壹般應使系統連續運行，不能脫人。
（8）編制必要的化驗和運轉的原始記錄報表以及初步的建章立制。從培菌伊始，逐步建立較規範的組織和管理模式，確保啟動與正式運行的有序進行。
2．自然培菌
自然培菌，也稱直接培菌法。它是利用廢水中原有的少量微生物，逐步繁殖的培養過程。城市汙水和壹些營養成份較全、毒性小的工業廢水，如食品廠、肉類加工廠廢水，可以考慮這種培養方法，但培養時間相對較長。自然培菌又可分為間歇培菌和連續培菌二種。
（1） 間歇培菌。將曝氣池註滿廢水，進行悶曝（即只曝氣而不進廢水），數天後停止曝氣，靜置沈澱1 h ，然後排出池內約1/5的上層廢水，並註入相同量的新鮮汙水。如此反復進行悶曝、靜沈和進水三個過程，但每次的進水量要比上次有所增加，而悶曝時間要比上次縮短。在春秋季節，約二、三周就可初步培養出汙泥。當曝氣池混合液汙泥濃度達到1克/升左右時，就可連續進水和曝氣。由於培養初期汙泥濃度較低，沈澱池內積累的汙泥也較少，回流量也要少壹些，此後隨著汙泥量的增多，回流汙泥量也要相應增加。當汙泥濃度達到工藝所需的濃度後，即可開始正常運行，按工藝要求進行控制。
（2） 連續培菌。先將曝氣池進滿廢水，然後停止進水，悶曝半天至壹天後可連續進水。連續曝氣，進水量從小到大逐漸增加，連續運行壹段時間（與間歇法差不多），就會有活性汙泥出現並逐漸增多。曝氣池汙泥量達到工藝所需的濃度時，按工藝要求進行控制。
由於自然培菌法是用廢水直接培養活性汙泥，其培菌過程也是微生物逐步適應廢水性質並獲得馴化的過程。
3．接種培菌
接種培菌法的培養時間較短，是常用的活性汙泥培菌方法，適用於大部分工業廢水處理廠。城市汙水廠如附近有種泥，也可采用此法，以縮短培養時間。接種培養法常用的有如下二種：
(1) 濃縮汙泥接種培菌。采用附近汙水處理廠的濃縮汙泥作菌種(種泥或種汙泥)來培養。城市汙水和營養齊全、毒性低的工業廢水處理系統的活性汙泥培養，可直接在所要處理的廢水中加入種泥進行曝氣，直至汙泥轉棕黃色時就可連續進汙水（進水量應逐漸增加），此時沈澱池也投入運行，讓汙泥在系統內循環。為了加快培養進程，可在培養過程中投加未發酵過的大糞水或其它營養物。活性汙泥濃度達到工藝要求值即完成了培菌過程。從經濟上講，種泥的量應盡可能少，壹般情況下控制在稀釋後使混合液汙泥濃度在0.5g/L以上。
對有毒工業廢水進行培菌時，可先向曝氣池引入河水，也可用自來水（需先曝氣壹段時間以脫去其中的余氯），然後投入種汙泥和未經發酵的大糞水進行曝氣，直至汙泥呈棕黃色後停止曝氣，讓汙泥沈降並排掉壹部分上清液，再次補充壹定量的大糞水繼續曝氣，待汙泥量明顯增加後，逐步提高廢水流量。在培菌的後期，汙泥中微生物已能較好地適應工業廢水水質。
（2）幹汙泥接種培菌。“幹汙泥”通常是指經過脫水機脫水後的泥餅，其含水率約為70～80%。本法適用於邊遠地區和取種汙泥運輸距離較遠的情況。
幹汙泥接種培菌的過程與濃縮汙泥培菌法基本相同。接種汙泥要先用剛脫水不久的新鮮泥餅，投加至曝氣池前需加少量水並搗成泥漿。幹汙泥的投加量壹般為池容積的2～5%。
幹汙泥中可能含有壹定濃度的化學藥劑(用於汙泥調理)，如藥劑含量過高、毒性較大，則不宜用作為培菌的種泥。鑒定汙泥能否作接種用，可將少量泥塊搗碎後放入小容器(如燒杯或塑料桶)內加水曝氣，經過壹段時間後如果泥色能轉黃，就可用於接種。