希伯萊字母曾被用來表示固定的數值，即前10個字母分別代表1至10，第11至第19個字母分別代表20、30、40……100等9個整數，第20至22個字母分別代表200、300、400。字母是代表壹個詞還是代表壹個數，只能根據句意去理解了。更令人難以理解的是，希伯萊文詞的數值又常被用來衍生詞語中隱藏的、神秘的含義，加上猶太神秘主義把每個希伯萊字母都賦予了壹種獨特的寓意，因而在許多人眼中，希伯萊字母具有壹種特殊的神秘色彩。
另外，希伯萊文的書寫方式從右到左，和其他文字從左到右的習慣恰恰相反。輔音字母之間不連寫，字母也沒有大寫、小寫之分，因此不易區別壹般名詞和人名、地名等專有名詞，這也給初學者帶來了很大的不便。
希伯萊文無元音字母的特殊現象給人們理解最早的用希伯萊文書寫的《聖經》和其他宗教經典帶來了壹定的困難，影響到人們對文本原始含義的理解。人們在對《聖經》、《塔木德》等希伯萊人經典作註解或詮釋時，出現了壹門獨立的、專門的希伯萊語語言學研究。
公元前586年猶大王國被新巴比倫所滅後，四處流散的猶太人為了適應新居住地的語言環境，不得不改學當地的語言，希伯萊語逐漸成為近乎“死亡”的語言，只是在誦經、禱告等宗教場合被作為書面語言使用，而不再是壹種有生命力的口頭語言。