過濾除菌法使用的主要設備是濾器，根據不同的目的和要求可以選擇不同的濾材和孔徑。濾材可以是紙、布、膜或活性炭等，孔徑壹般在0.1-10微米之間。通過將待處理的液體或氣體經過濾器進行過濾，可以有效地去除其中的微生物，包括細菌、真菌、病毒和其他微生物。相對於化學消毒法，過濾除菌法更加環保且不會產生有害物質，因此被廣泛應用於飲用水、藥品生產、實驗室和醫療設施等領域。
需要註意的是，過濾除菌法雖然可以去除大部分的微生物，但不能完全達到100%的去除率。此外，濾材使用時間長了會堵塞，甚至失效，因此需要定期更換和清洗。同時，在采用過濾除菌法時，也需要根據實際情況和需求選擇適當的濾材和濾器類型，並進行合理的操作和維護，以確保其效果和安全性。