硝化細菌用於控制養殖池水自生氨濃度的處理劑，不僅使用相當方便，而且能發揮立竿見影的效果，故越來越受魚友的歡迎。使用時可直接將該劑散布於池中，不久即能發揮除氨的功效。
市售硝化細菌制劑可分為活菌及休眠菌兩種，可依自己的需要選購使用。前者是利用細菌的活體制成，在顯微鏡的觀察下，可看到它們的活動情形。後者是利用休眠菌制成，在顯微鏡的觀察中，則無法看到它們具有活動能力。
選擇活菌的好處是除氨效果迅速，最適用於氨濃度過高的緊急情況。但是因活菌對氧氣的要求十分嚴格，尤其是硝酸菌屬的細菌只能在有充份氧氣存在下才能生存。
正因為如此，要將活菌保存並制成產品，常有保存上的困難，所以在購買這類產品時，要特別註意它的有效使用期限，如果使用過期產品，就除氨的觀點而言，是沒有什麽效率的。
擴展資料
除了棲息環境很少外，硝化細菌的生殖很慢，也是壹項非常不利的弱點。某些學者（如Shilo and Rimon，1982；Belse，1984）曾就養殖池中的硝化細菌作過生長及繁殖速度的測定，結果發現壹些常見的亞硝酸菌種平均要花上26小時才能增殖壹倍。
而硝酸菌種生殖的周期更長，平均要花上60小時才能增殖壹倍。硝化細菌在養殖池中的低生殖率，使它們在微生物的生態系中僅占有壹個相當低的百分率。
就環境因子而言，影響硝化細菌最重要的因子主要有光線、pH值及溫度的變化等，它們僅能在合適的環境因子中生長及繁衍，
如果這些因子的變化超出了它們所能忍受的範圍，就很容易受到傷害，嚴重的話，將引起死亡。
光對硝化細菌的不良影響是壹般人很難想象的，從許多的相關研究中均顯示光對硝化細菌的生長及繁殖均有抑制的現象。亞硝酸菌對近紫外線的可見光非常敏感（Alleman，1987），但太陽光中普遍含有這種光譜。紫外線對硝化細菌的傷害更大。因此在生態上，硝化細菌均有避光現象（Alleman，1987）。
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