主要區別：細胞中的核糖體分為內質網上的核糖體和遊離的核糖體，內質網上的核糖體合成的蛋白質分泌到細胞外，遊離核糖體合成的蛋白質不分泌到細胞外，所以細胞質的核糖體是不等於遊離的核糖體的。
即將分泌到胞外的蛋白它進入內質網那是因為要進行加工，內質網加工可能還會經過高爾基體的加工才能以膜泡的形式分泌的細胞外。
信號肽介導多肽進入內質網後信號肽就會被切了，成熟的蛋白是沒有信號肽的。
結構蛋白是蛋白質的另壹種分類，結構蛋白可以是胞內的也可以是胞外的，所以不能肯定的說它是哪的核糖體合成的。
如果它不能正常進入內質網，那它下壹步的命運就是被降解，產生的氨基酸再次用來合成蛋白。
擴展資料：
因為核糖體的結構和其他細胞器有顯著差異，如沒有膜包被、由兩個亞基組成、因為功能需要可以附著至內質網或遊離於細胞質，核糖體有時不被認為是壹類細胞器，而是細胞內大分子。
無論哪種核糖體，在執行功能時，即進行蛋白質合成時，常3-5個或幾十個甚至更多聚集並與mRNA結合在壹起，由mRNA分子與小亞基凹溝處結合，再與大亞基結合，形成壹串，稱為多聚核糖體（遊離多聚核糖體及固著多聚核糖體）。
mRNA的長短，決定多聚核糖體的多少，可排列成螺紋狀，念珠狀等，多聚核糖體是合成蛋白質的功能團。
此時，每壹核糖體上均在以mRNA的密碼為模板，翻譯成蛋白質的氨基酸順序。在活細胞中，核糖體的大小亞基，單核糖體和多聚核糖體是處於壹種不斷解聚與聚合的動態平衡中，隨功能而變化，執行功能量為多聚核糖體、功能完成後解聚為大、小亞基。
在大亞基內有壹垂直的通道為中央管，所合成的多肽鏈由此排放，以免受蛋白酶的分解。壹般真核細胞中，10的6次方到7次方個/細胞，原核細胞中15-18×10的三次方個/細胞，蛋白質合成旺盛的細胞可達1×10的12次方個/細胞。
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