1、表達方式不同。昆曲以演唱和舞蹈的形式表達劇情，強調視覺效果和舞臺效果；秦腔則是文言文的敘述方式。
2、情節編排不同。昆曲版本的《竇娥冤》中，角色形象的刻畫更加鮮明，比原文更加符合人物性格特征；秦腔只是貼合原文，並沒有其他編排。